BindingDB logo
myBDB logout

Validation sets for computational chemistry

This page provides about 1200 protein-ligand binding datasets within the BindingDB collection that are designed to be useful for parameterizing or testing protein-ligand modeling codes. Each set has roughly 10-50 congeneric small molecules with a range of affinities for a single protein target, and at least one complex in each series has a structure in the PDB, as a basis for modeling the rest of the series.

Each row in the following table corresponds to one dataset and provides the article(s) from which the data were drawn, a freely downloadable SDfile with the compounds and data, and a link to preview the compounds on-line. No effort has been made to establish appropriate protonation or tautomer states of the compounds. The 3D SDfiles on this page provide conformations for the free molecules generated with the program Vconf.

These validation sets were regenerated January 2020 to take advantage of the increases in data holdings of both BindingDB and the PDB. There are now more data sets than before, and it is unlikely that any present set exactly matches any prior set. All of the prior sets are still available for view and download as a zip file here.

The present validation sets were generated as follows. We first identified every PDB protein-ligand cocrystal structure whose protein and ligand (HET group) exactly match a measurement in BindingDB. Then, for each of these PDBs, we we recovered all the other compounds in BindingDB with binding data for the protein and having a maximum common substructure (MCSS) with the HET group that encompassed at least 0.6 of the non-hydrogen atoms in the HET group, and that also had a Tanimoto similarity of at least 0.6 with the HET group. If these filters left five or fewer ligands, the set was discarded. This procedure generated an initial collection of validation sets. This initial collection was then condensed by merging any two sets if they had the same protein and if either HET ligand was the same as one of the non-HET BindingDB ligands in the other. MCSS was computed with the OpenEye API, and Tanimoto similarity indices were computed with JChem fingerprints. All the current sets can be downloaded as a zip file.


1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 12110/1154.0 - 6500000 nM1ONP-FOM 1Q0H-FOM 1Q0L-FOM 2EGH-FOM J Med Chem 2005 48:3547-63 J Med Chem 2014 57:8827-38 Chembiochem 2005 6:1866-74 2D 3D TSV
11-beta-Hydroxysteroid Dehydrogenase 1 (11-beta-HSD1)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2820/221.10 - 17.0 nM3CH6-311 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:3168-72 2D 3D TSV
Set 32021/30250 - 1000 nM3CZR-3CZ Bioorg Med Chem Lett 2008 18:3513-6 2D 3D TSV
17-beta-Hydroxysteroid Dehydrogenase 5 (17-beta-HSD5, AKR1C3)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 46114/178.00 - 30000 nM3R43-ID8 3R6I-JMS J Nat Prod 2012 75:716-21 J Med Chem 2012 55:2311-23 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:4437-40 US9271961 Eur J Med Chem 2013 62:738-44 2D 3D TSV
Set 56619/2312.0 - 30000 nM4FAL-0T0 4FAM-0SZ Bioorg Med Chem Lett 2016 26:5631-5638 J Med Chem 2012 55:7746-58 Eur J Med Chem 2013 62:738-44 2D 3D TSV
Set 64316/2125.0 - 30000 nM4HMN-16J Bioorg Med Chem 2014 22:967-77 2D 3D TSV
2'-deoxynucleoside 5'-phosphate N-hydrolase 1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 72526/35500 - 93000 nM4P5E-N6P Eur J Med Chem 2014 85:418-37 2D 3D TSV
2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 8620/2970000 - 200000 nM3KE1-829 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:6860-3 2D 3D TSV
3',5'-cyclic phosphodiesterase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 916721/340.050 - 10000 nM1UHO-VDN 3B2R-VDN Bioorg Med Chem Lett 2002 12:865-8 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:3900-7 J Med Chem 2014 57:3588-93 J Med Chem 2018 61:1001-1018 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:4271-4 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:2790-4 J Med Chem 2001 43:5037-43 Eur J Med Chem 2013 60:285-94 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:2099-103 J Med Chem 2017 60:6622-6637 J Med Chem 2000 43:2523-9 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:2461-4 J Med Chem 2008 51:2807-15 Bioorg Med Chem 2015 23:2121-8 J Med Chem 2016 59:8967-9004 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:2587-90 J Med Chem 2001 43:1257-63 J Med Chem 2012 55:10540-50 Bioorg Med Chem 2008 16:7599-606 2D 3D TSV
Set 1019920/320.280 - 1000 nM4D08-Q2T US9669035 ACS Med Chem Lett 2015 6:282-6 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:785-90 ACS Med Chem Lett 2014 5:1049-53 US9085584 US9540379 2D 3D TSV
3-phosphoinositide dependent protein kinase-1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 112025/373.00 - 10000 nM3ION-8H1 3IOP-8I1 Nat Biotechnol 2011 29:1046-51 Eur J Med Chem 2010 45:1379-86 2D 3D TSV
Set 12624/2912.0 - 220 nM1Z5M-LI8 J Biol Chem 2005 280:19867-74 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:7169-73 J Biol Chem 2011 286:6433-48 J Med Chem 2013 56:2726-37 2D 3D TSV
Set 131522/2540.0 - 7500 nM2R7B-253 J Med Chem 2007 50:5547-9 2D 3D TSV
Set 14633/381.70 - 190 nM1OKY-STO Nat Biotechnol 2011 29:1046-51 Blood 2009 114:2984-92 PubChem BioAssay aid1433 Nat Biotechnol 2008 26:127-32 2D 3D TSV
Set 155513/3510.0 - 29000 nM3NUN-JMZ 3QCQ-3Q0 3QCS-3Q1 3QCX-3Q2 3QCY-3Q3 3QD0-3Q4 3QD3-3Q5 3QD4-3Q6 J Med Chem 2011 54:1871-95 ACS Med Chem Lett 2010 1:439-442 J Med Chem 2013 56:2726-37 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:6895-8 2D 3D TSV
Set 161223/350.600 - 320 nM3RWP-ABQ 3RWQ-3RW J Med Chem 2011 54:8490-500 2D 3D TSV
3-Phosphoinositide-Dependent Protein Kinase 1 (PDK1)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 171020/2743.0 - 7500 nM3H9O-9BD Bioorg Med Chem Lett 2009 19:5225-8 2D 3D TSV
5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 182013/230.600 - 90000000 nM1G6S-S3P 1G6T-S3P 1X8R-SC1 2AA9-SKM 2AAY-SKM Biochemistry 1988 27:1604-10 2D 3D TSV
A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 4 (ADAMTS-4)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 19721/264.00 - 110 nM4WKE-3PU 4WKI-3PW J Med Chem 2014 57:10476-85 2D 3D TSV
ABL
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 203419/280.020 - 2100 nM2HZI-JIN Bioorg Med Chem 2010 18:6316-21 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:6872-6 Chem Biol 2006 13:779-86 2D 3D TSV
Acetolactate synthase catalytic subunit, mitochondrial
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 21622/253.30 - 400 nM1N0H-CIE 1T9A-1TB J Med Chem 2013 56:210-9 2D 3D TSV
Acetylcholine Binding protein
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 22713/140.067 - 160 nM3U8J-09O 3U8M-09R J Biol Chem 2012 287:4248-59 Eur J Med Chem 2015 102:425-44 2D 3D TSV
Acetylpolyamine amidohydrolase (APAH)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2369/1268.0 - 1800000 nM4ZUO-XS6 Biochemistry 2015 54:4692-703 Bioorg Med Chem 2013 21:4530-40 2D 3D TSV
Adenosine kinase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2416920/240.100 - 20000 nM4O1L-HO4 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:3077-9 J Med Chem 2003 46:4750-60 J Med Chem 2014 57:8268-79 J Med Chem 2005 48:6430-41 J Med Chem 2011 54:5498-507 J Med Chem 2000 43:2894-905 J Med Chem 2005 48:3389-99 J Med Chem 2005 48:7808-20 J Med Chem 1993 36:3424-30 J Med Chem 2000 43:2883-93 2D 3D TSV
Adenosylhomocysteinase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 25815/191.00 - 9700 nM1K0U-DEA J Med Chem 1991 34:647-56 Bioorg Med Chem 2015 23:4952-69 J Med Chem 1993 36:883-7 2D 3D TSV
Alcohol dehydrogenase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2696/101000 - 920000 nM1U3V-HPL J Med Chem 1998 41:1696-701 2D 3D TSV
Set 27128/12880 - 24000 nM1U3T-CCB J Med Chem 1998 41:1696-701 2D 3D TSV
Aldehyde dehydrogenase (ALDH2)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 281212/1850.0 - 100000 nM4KWF-3AK J Med Chem 2014 57:714-22 2D 3D TSV
Set 293821/3540.0 - 9000 nM2VLE-DZN J Med Chem 2001 44:3320-8 J Med Chem 2000 43:4169-79 2D 3D TSV
Aldehyde dehydrogenase 1A1 (ALDH1A1)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 301320/26240 - 20000 nM4WPN-3ST J Med Chem 2015 58:1964-75 2D 3D TSV
Aldo-keto reductase family 1 member C1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 311311/171.30 - 460 nM3NTY-5P3 Eur J Med Chem 2010 45:5309-17 J Med Chem 2012 55:7417-24 J Med Chem 2009 52:3259-64 2D 3D TSV
Aldo-keto reductase family 1 member C2
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 326014/17150 - 100000 nM4JQA-ID8 J Med Chem 2012 55:2311-23 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:4437-40 US9271961 Eur J Med Chem 2013 62:738-44 2D 3D TSV
Aldo-keto-reductase family 1 member C3
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 331118/23380 - 150000 nM4FA3-0SL J Med Chem 2012 55:7746-58 J Med Chem 2012 55:7417-24 2D 3D TSV
Aldose Reductase (ALR2) Mutant (C298A/W219Y)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 341010/101000 - 170000 nM2ISF-PAC Bioorg Chem 2006 34:424-44 2D 3D TSV
ALK tyrosine kinase receptor
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 3535426/420.120 - 35000 nM2XB7-GUI ACS Med Chem Lett 2014 5:304-8 ACS Med Chem Lett 2010 1:493-498 US10053458 US9783524 J Med Chem 2012 55:449-64 J Med Chem 2015 58:197-211 J Med Chem 2014 56:5673-4 US10100019 J Med Chem 2016 59:4948-64 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:3992-8 Bioorg Med Chem Lett 2010 21:463-6 Bioorg Med Chem Lett 2016 26:1720-5 US9199944 J Med Chem 2016 59:7478-96 Bioorg Med Chem Lett 2017 27:2185-2191 J Med Chem 2014 56:5675-90 US8592432 Eur J Med Chem 2017 126:536-549 2D 3D TSV
Set 362633/443.00 - 1800 nM5FTO-YMX 5FTQ-U4W J Med Chem 2016 59:3392-408 2D 3D TSV
Set 3718322/360.168 - 2400 nM3AOX-EMH Eur J Med Chem 2016 118:244-9 Bioorg Med Chem 2012 20:1271-80 J Med Chem 2011 54:6286-94 US9126931 Bioorg Med Chem Lett 2016 26:5399-5402 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:3788-93 2D 3D TSV
Alpha-galactosidase A
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 382010/153.00 - 2000000 nM3S5Y-DGJ Bioorg Med Chem Lett 2003 14:73-5 J Med Chem 2005 48:2036-44 Bioorg Med Chem 2010 18:3790-4 J Med Chem 1998 41:2565-71 Eur J Med Chem 2016 123:14-20 Eur J Med Chem 2017 126:1-6 ACS Chem Biol 2014 9:1460-9 Bioorg Med Chem Lett 2016 26:1438-42 2D 3D TSV
Alpha-glucosidase A (α-Gal A)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 39209/153.00 - 2000000 nM3GXT-DNJ J Med Chem 2005 48:2036-44 Bioorg Med Chem 2010 18:3790-4 J Med Chem 1998 41:2565-71 Eur J Med Chem 2016 123:14-20 Eur J Med Chem 2017 126:1-6 ACS Chem Biol 2014 9:1460-9 Bioorg Med Chem Lett 2016 26:1438-42 2D 3D TSV
AMPK alpha2/beta1/gamma1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 40820/273.00 - 61.0 nM4CFE-992 J Med Chem 2017 60:9040-9052 2D 3D TSV
Anandamide amidohydrolase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 415019/260.800 - 10000 nM4HBP-17J Bioorg Med Chem Lett 2011 21:2492-6 Bioorg Med Chem 2012 21:28-41 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:4674-85 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:4838-43 2D 3D TSV
Androgen receptor
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 423320/281.70 - 33000 nM3B67-B67 ACS Med Chem Lett 2013 4:937-41 US10053433 Bioorg Med Chem Lett 1999 9:1009-12 J Med Chem 2001 44:1729-40 Biochem Biophys Res Commun 1998 244:1-4 J Med Chem 2009 52:3597-617 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:5567-70 Bioorg Med Chem 2006 14:6525-38 J Med Chem 2004 47:993-8 J Med Chem 2014 57:2462-71 2D 3D TSV
Set 432819/231.10 - 5000 nM1XOW-R18 1XQ3-R18 2AO6-R18 J Med Chem 2005 48:5666-74 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:1834-8 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:2944-8 J Med Chem 1996 39:1778-89 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:834-8 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:6295-8 J Med Chem 2004 47:4985-8 J Pharmacol Exp Ther 2005 313:916-20 US9034856 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:5573-6 2D 3D TSV
Angiotensin-converting enzyme
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 441322/281.40 - 340 nM1R4L-XX5 J Am Chem Soc 2002 124:11852-3 2D 3D TSV
Set 456312/161.70 - 1000000000 nM1UZF-X8Z J Med Chem 2003 46:3326-32 J Med Chem 2002 45:5609-16 J Med Chem 1994 37:3994-4002 J Med Chem 1997 40:3161-72 Eur J Med Chem 2014 84:100-6 J Med Chem 1981 24:104-9 J Med Chem 1993 36:2390-403 J Med Chem 1993 36:2051-8 J Med Chem 1995 38:2705-13 J Nat Prod 1988 51:357-359 J Nat Prod 2015 78:1179-83 2D 3D TSV
Set 46728/4054.0 - 79000000 nM4BZR-K26 Eur J Med Chem 2014 84:100-6 ACS Med Chem Lett 2014 5:346-51 2D 3D TSV
Set 4712017/320.800 - 850000 nM1O86-LPR 1UZE-EAL 2C6N-LPR J Med Chem 2000 43:305-41 J Med Chem 2005 48:6523-43 J Med Chem 1989 32:289-97 J Med Chem 1994 37:3994-4002 Bioorg Med Chem Lett 2017 27:2313-2318 J Med Chem 1989 32:1600-6 Eur J Med Chem 2014 84:100-6 J Med Chem 1985 28:1291-5 J Med Chem 1993 36:2390-403 J Med Chem 1985 28:434-42 J Med Chem 2002 45:5609-16 J Med Chem 1986 29:251-60 J Med Chem 1997 40:3161-72 J Med Chem 1991 34:511-7 J Med Chem 1986 29:1953-61 2D 3D TSV
Set 481135/540.400 - 1500 nM2XY9-3ES 4CA5-3EF J Med Chem 2010 53:208-20 J Med Chem 2011 54:5955-80 2D 3D TSV
Apoptosis Signal-regulating Kinase 1 (ASK1)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 49833/386.30 - 110000 nM2CLQ-STO Nat Biotechnol 2011 29:1046-51 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:3752-5 Blood 2009 114:2984-92 US9051313 PubChem BioAssay aid1433 Nat Biotechnol 2008 26:127-32 2D 3D TSV
Set 501522/276.30 - 870 nM3VW6-IM6 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:7326-9 Bioorg Med Chem 2011 19:486-9 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:4418-23 2D 3D TSV
Aromatase (CYP19)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5123719/211.00 - 500000 nM3EQM-ASD 3S79-ASD J Med Chem 1996 39:2245-52 Eur J Med Chem 2009 44:4121-7 Eur J Med Chem 2008 43:1865-77 J Med Chem 2001 44:4277-83 J Med Chem 2012 55:3992-4002 Eur J Med Chem 2010 45:5612-20 J Med Chem 2005 48:6379-85 J Med Chem 1991 34:2496-504 J Med Chem 1991 34:1344-9 J Med Chem 1997 40:3263-70 J Med Chem 1991 34:725-36 Bioorg Med Chem 2016 24:2823-31 J Med Chem 2016 59:5131-48 J Med Chem 1990 33:2933-42 J Med Chem 2012 55:8464-76 J Med Chem 1986 29:582-4 J Med Chem 1989 32:651-8 Eur J Med Chem 2015 102:375-86 J Med Chem 1996 39:757-72 J Med Chem 1983 26:50-4 J Med Chem 1992 35:1588-97 J Med Chem 1991 34:1748-50 J Med Chem 1994 37:2198-205 J Med Chem 1994 37:1312-9 J Med Chem 1995 38:2842-50 J Med Chem 1996 39:1033-8 Eur J Med Chem 2015 105:1-38 J Med Chem 1989 32:203-13 2D 3D TSV
Set 523123/317.00 - 44000 nM4GL5-G29 4GL7-0XJ J Med Chem 1996 39:2245-52 J Med Chem 2012 55:8464-76 J Med Chem 1991 34:1344-9 J Med Chem 2001 44:4277-83 Eur J Med Chem 2014 87:336-45 Eur J Med Chem 2015 105:1-38 Eur J Med Chem 2010 45:5612-20 2D 3D TSV
ATPase family AAA domain-containing protein 2
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 537615/3779.0 - 500000 nM5A5Q-6XC 5A5R-NP8 5A81-78J 5A82-YEJ 5A83-YD3 J Med Chem 2015 58:5649-73 J Med Chem 2015 58:6151-78 2D 3D TSV
Set 541214/1713000 - 500000 nM5A5P-JTF J Med Chem 2015 58:5649-73 2D 3D TSV
Aurora kinase A
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 554820/331.00 - 260 nM3E5A-VX6 Eur J Med Chem 2014 78:65-71 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:5296-300 J Med Chem 2009 52:2629-51 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:3586-92 J Med Chem 2012 55:3250-60 Bioorg Med Chem Lett 2016 26:5860-5862 2D 3D TSV
Set 567818/362.00 - 2200 nM2X6D-X6D 2X6E-YM4 4B0G-VEK J Med Chem 2010 53:5213-28 Eur J Med Chem 2010 46:77-94 J Med Chem 2012 55:8721-34 US9447092 2D 3D TSV
Set 57617/233.50 - 70.0 nM2W1F-L0F J Med Chem 2009 52:379-88 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:3523-30 2D 3D TSV
Set 58624/330.600 - 6000 nM2X81-ZZL ACS Med Chem Lett 2015 6:630-4 J Med Chem 2013 56:6991-7002 US9012475 2D 3D TSV
Set 59615/15470 - 3000 nM4JAJ-XU1 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:3081-7 2D 3D TSV
Set 602419/310.300 - 1200 nM4JAI-XU2 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:3081-7 2D 3D TSV
Set 612024/2771.2 - 150000 nM2NP8-CC3 US9249124 J Med Chem 2012 55:7392-416 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:688-91 2D 3D TSV
Axin-1/Glycogen synthase kinase-3 beta
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 621419/214.00 - 1500 nM1Q41-IXM J Med Chem 2017 60:8482-8514 Bioorg Med Chem 2010 18:4509-15 27689729Eur J Med Chem 2015 107:63-81 J Med Chem 2017 60:4949-4962 2D 3D TSV
B-N-acetylhexosaminidase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 63518/19100000 - 2000000 nM1HP5-NGT Bioorg Med Chem Lett 2008 18:2944-7 2D 3D TSV
Beta-galactosidase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 64810/13180 - 150000 nM3THD-DGJ Eur J Med Chem 2017 126:160-170 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:2489-93 Bioorg Med Chem Lett 2016 26:1438-42 2D 3D TSV
Beta-glucuronidase (EcGUS)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 65626/28160 - 1900 nM3LPF-Z77 5CZK-57Z Chem Biol 2015 22:1238-49 2D 3D TSV
Beta-ketoacyl-ACP synthase (KasA) C171Q
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 661513/1414000 - 400000 nM2WGE-TLM J Biol Chem 2013 288:6045-52 2D 3D TSV
beta-Ketoacyl-ACP Synthase III (FabH)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 67826/271600 - 160000 nM3IL5-B82 Eur J Med Chem 2008 43:1071-80 2D 3D TSV
Beta-lactamase AmpC
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 68517/181000 - 93000 nM1L2S-STC Chem Biol 2001 8:593-611 Nat Chem Biol 2006 2:720-3 J Med Chem 2005 48:3714-28 2D 3D TSV
Set 69826/3011000 - 17000 nM2R9W-23C PubChem BioAssay aid1003 2D 3D TSV
Set 7059/112900 - 100000 nM1KDW-4CB J Med Chem 1998 41:4577-86 2D 3D TSV
Beta-mannosidase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 71518/1857.0 - 2400 nM2VMF-MVL Nat Chem Biol 2008 4:306-12 2D 3D TSV
beta-Secretase (BACE-1)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 722031/3826.0 - 11000 nM2FDP-FRP J Med Chem 2006 49:839-42 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:4843-6 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:1643-7 J Med Chem 2004 47:158-64 2D 3D TSV
Set 735830/510.800 - 20000 nM2F3E-AXQ 2F3F-AXF J Med Chem 2011 54:3081-5 J Med Chem 2003 46:2074-82 J Med Chem 2005 48:5175-90 J Med Chem 2006 49:4544-67 J Med Chem 2009 52:2163-76 J Med Chem 2001 44:2865-8 J Med Chem 2004 47:5791-7 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:1924-7 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:1366-70 2D 3D TSV
Beta-secretase 1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 741823/3724.0 - 57000 nM3UFL-508 US8865701 US9505739 Bioorg Med Chem Lett 2011 22:240-4 2D 3D TSV
Set 751918/2926.0 - 100000 nM4B1D-6TG US8865911 J Med Chem 2012 55:9297-311 2D 3D TSV
Set 7639915/300.200 - 140000 nM3IND-593 3INE-X17 4JP9-1M5 4JPC-1M6 4N00-2EX 4PZW-2X4 4PZX-2X5 4R5N-3J9 4RRN-3UW 4RRO-3UX 4RRS-3UY Bioorg Med Chem Lett 2014 24:2033-45 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:2444-9 J Med Chem 2010 53:1146-58 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:632-5 Eur J Med Chem 2010 46:58-64 US8981112 US9018391 J Med Chem 2013 56:3379-403 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:6597-605 US9353089 US9242973 J Med Chem 2014 57:10112-29 ACS Med Chem Lett 2012 3:871-872 US8957083 US8865911 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:2477-80 US8975415 J Med Chem 2014 57:9796-810 J Med Chem 2014 57:9811-31 J Med Chem 2012 55:9156-69 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:767-74 2D 3D TSV
Set 7731317/320.200 - 45000 nM3IN3-472 3IN4-BX2 3INF-X45 3INH-569 3LHG-Z81 3OOZ-ZOO 3S7L-591 3S7M-532 4DJW-0KP 4JPE-1M7 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:2033-45 Bioorg Med Chem 2010 18:630-9 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:2444-9 J Med Chem 2010 53:1146-58 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:2326-9 Eur J Med Chem 2010 46:58-64 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:6597-605 US8957083 US9353089 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:5164-70 ACS Med Chem Lett 2012 3:897-902 J Med Chem 2013 56:3379-403 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:1854-9 J Med Chem 2009 52:6314-23 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:632-5 US8981112 US9018391 2D 3D TSV
Set 7882122/650.140 - 200000 nM2IQG-F2I 2P83-MR0 2QK5-CS5 2QMD-CS7 2QMF-CS9 2QMG-SC6 2QP8-SC7 2VKM-BSD 3CIB-314 3CIC-316 3CID-318 3IVH-1LI 3IVI-2LI 3IXJ-586 3IXK-929 3K5C-0BI 3LNK-74A 3LPI-Z74 3LPJ-Z75 3LPK-Z76 3N4L-842 3NSH-957 3R2F-PB0 3SKG-PB8 3VEU-0GO 4DPF-0LG 4DPI-0N1 4GID-0GH 4I0I-957 4I0J-842 US9096541 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:3236-41 Bioorg Med Chem 2009 17:1600-13 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:418-22 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:4789-94 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:6231-6 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:1643-7 J Med Chem 2009 52:6484-8 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:6034-9 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:2654-60 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:6909-15 J Med Chem 2007 50:776-81 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:823-7 Bioorg Med Chem 2010 18:3088-115 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:6386-91 Bioorg Med Chem Lett 2017 27:2432-2438 Bioorg Med Chem Lett 2008 19:264-74 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:1942-7 Bioorg Med Chem Lett 2006 17:73-7 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:4843-6 J Med Chem 2004 47:158-64 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:414-7 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:2837-42 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:3378-83 J Med Chem 2012 55:9331-45 J Med Chem 2012 55:9195-207 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:1017-21 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:6916-24 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:1022-6 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:603-7 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:3992-6 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:1031-6 Bioorg Med Chem 2015 23:1963-74 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:3635-8 J Med Chem 2008 51:3313-7 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:641-4 J Med Chem 2006 49:6147-50 Bioorg Med Chem 2010 18:1711-23 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:3664-8 J Med Chem 2007 50:2399-407 Bioorg Med Chem 2008 16:9471-86 Eur J Med Chem 2010 45:542-54 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:4639-44 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:1011-6 Bioorg Med Chem 2012 20:4377-89 J Med Chem 2006 49:7270-3 J Med Chem 2012 55:10749-65 Bioorg Med Chem Lett 2010 21:358-62 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:3669-73 US8703947 Eur J Med Chem 2010 45:870-82 Eur J Med Chem 2017 125:676-695 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:1885-9 J Med Chem 2006 49:839-42 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:1924-7 Bioorg Med Chem Lett 2006 17:78-81 J Med Chem 2012 55:3364-86 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:2900-4 J Med Chem 2010 53:1458-64 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:4273-6 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:1527-31 Bioorg Med Chem Lett 2004 15:211-5 Bioorg Med Chem 2016 24:3276-82 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:1366-70 J Med Chem 2004 47:5791-7 J Med Chem 2012 55:1303-17 J Med Chem 2009 52:2163-76 J Med Chem 2001 44:2039-60 J Med Chem 2003 46:2074-82 J Med Chem 2011 54:3081-5 J Med Chem 2005 48:5175-90 J Med Chem 2003 46:1799-802 J Med Chem 2015 58:5408-18 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:668-72 J Med Chem 2002 45:259-62 J Med Chem 2011 54:1961-2004 Bioorg Med Chem Lett 2003 14:239-43 Bioorg Med Chem Lett 2003 14:245-50 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:4335-9 2D 3D TSV
Set 794625/4126.0 - 70000 nM3K5F-AYH J Med Chem 2011 54:1961-2004 Bioorg Med Chem Lett 2003 14:239-43 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:601-4 Bioorg Med Chem Lett 2003 14:245-50 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:4843-6 J Med Chem 2001 44:2039-60 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:1924-7 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:1643-7 J Med Chem 2004 47:158-64 2D 3D TSV
Set 809236/580.800 - 89000 nM1XS7-MMI J Med Chem 2011 54:3081-5 J Med Chem 2003 46:2074-82 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:191-5 J Med Chem 2005 48:5175-90 J Med Chem 2015 58:5408-18 Bioorg Med Chem Lett 2004 15:159-62 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:668-72 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:15-20 J Med Chem 2001 44:2865-8 J Med Chem 2004 47:5791-7 J Med Chem 2012 55:1303-17 J Med Chem 2011 54:1961-2004 Eur J Med Chem 2010 45:870-82 Bioorg Med Chem Lett 2003 14:239-43 Bioorg Med Chem Lett 2003 14:245-50 J Med Chem 2009 52:2163-76 Eur J Med Chem 2010 45:2089-94 J Med Chem 2001 44:2039-60 J Am Chem Soc 2006 128:5310-1 2D 3D TSV
Set 8110822/420.800 - 200000 nM3DUY-AFJ 3DV1-AR9 3K5D-XLI J Med Chem 2011 54:3081-5 J Med Chem 2003 46:2074-82 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:191-5 J Med Chem 2005 48:5175-90 J Med Chem 2006 49:4544-67 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:1366-70 J Med Chem 2003 46:1799-802 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:1361-5 J Med Chem 2002 45:259-62 J Med Chem 2001 44:2865-8 J Med Chem 2004 47:5791-7 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:1924-7 J Med Chem 2004 47:158-64 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:6909-15 Bioorg Med Chem Lett 2003 14:245-50 J Med Chem 2009 52:2163-76 J Med Chem 2007 50:2399-407 J Med Chem 2014 57:7644-62 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:4335-9 J Med Chem 2003 46:4625-30 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:3457-60 Bioorg Med Chem Lett 2003 14:239-43 2D 3D TSV
Set 8212633/540.140 - 63000 nM2P4J-23I J Med Chem 2012 55:9195-207 Bioorg Med Chem 2009 17:1600-13 Bioorg Med Chem Lett 2017 27:2432-2438 J Med Chem 2010 53:1458-64 Bioorg Med Chem Lett 2008 19:264-74 Bioorg Med Chem 2012 20:4377-89 J Med Chem 2012 55:10749-65 J Med Chem 2006 49:839-42 J Med Chem 2009 52:6484-8 Bioorg Med Chem Lett 2010 21:358-62 US8703947 Bioorg Med Chem 2010 18:1711-23 Bioorg Med Chem 2010 18:3088-115 Eur J Med Chem 2010 45:870-82 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:1031-6 J Med Chem 2007 50:2399-407 Bioorg Med Chem 2008 16:9471-86 Eur J Med Chem 2010 45:542-54 Eur J Med Chem 2017 125:676-695 2D 3D TSV
Set 831034/484.40 - 1100 nM2G94-ZPQ J Med Chem 2003 46:2074-82 J Med Chem 2009 52:2163-76 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:668-72 J Med Chem 2001 44:2865-8 J Med Chem 2004 47:5791-7 J Am Chem Soc 2006 128:5310-1 2D 3D TSV
Set 846118/3478.0 - 7200 nM2QU2-251 2ZDZ-310 2ZE1-411 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:632-5 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:1063-6 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:767-71 2D 3D TSV
Set 853719/2830.0 - 29000 nM4DJV-0KM Bioorg Med Chem Lett 2012 22:2444-9 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:2326-9 Eur J Med Chem 2010 46:58-64 US9353089 ACS Med Chem Lett 2012 3:897-902 2D 3D TSV
Set 8612318/270.358 - 52000 nM4X7I-3YS US9540359 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:2033-45 J Med Chem 2013 56:3980-95 J Med Chem 2015 58:2678-702 ACS Med Chem Lett 2013 4:379-80 US8754075 US9296734 US9493485 US8999980 Bioorg Med Chem Lett 2016 26:5729-5731 US9650371 US9273053 US8633188 US9605007 US8541408 US8987254 US9029367 US9744173 US9611261 2D 3D TSV
Set 8719014/271.00 - 86000000 nM4WY1-3VO 4WY6-3VP 4X2L-3WP 4XXS-SI5 4YBI-4B2 US8933221 J Med Chem 2015 58:2678-702 US9045498 US9605007 US8865706 US9403846 US8962616 US9744173 J Med Chem 2015 58:3223-52 US9233981 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:2033-45 J Med Chem 2013 56:3980-95 US8633188 US8541408 J Med Chem 2018 61:619-637 ACS Med Chem Lett 2016 7:271-6 2D 3D TSV
Set 883421/2222.0 - 30000 nM3IGB-454 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:1854-9 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:2033-45 J Med Chem 2009 52:6314-23 2D 3D TSV
Set 891323/2626.0 - 30000 nM3U6A-18P J Med Chem 2015 58:8216-35 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:2033-45 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:7255-60 2D 3D TSV
Set 904217/199.90 - 8700 nM4JOO-1M4 J Med Chem 2014 57:10112-29 Eur J Med Chem 2010 46:58-64 J Med Chem 2013 56:3379-403 2D 3D TSV
Set 913721/403.00 - 78000 nM3L5E-BDW 4R8Y-3KO 4R91-3KT 4R92-3KU 4R93-779 J Med Chem 2010 53:951-65 Bioorg Med Chem Lett 2015 24:5455-9 2D 3D TSV
Set 921224/3955.0 - 24000 nM3DV5-BAV Bioorg Med Chem Lett 2011 21:6909-15 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:1366-70 Bioorg Med Chem Lett 2017 27:2432-2438 J Med Chem 2012 55:3364-86 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:4335-9 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:2900-4 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:1924-7 2D 3D TSV
Set 934036/551.20 - 10000 nM3KYR-038 Bioorg Med Chem 2011 19:145-55 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:1527-31 Bioorg Med Chem Lett 2004 15:211-5 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:2380-6 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:1572-6 Bioorg Med Chem 2010 18:3175-86 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:1649-53 ACS Med Chem Lett 2012 3:193-197 2D 3D TSV
Set 941524/28140 - 8300 nM2QU3-462 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:5353-6 2D 3D TSV
Set 954716/284600 - 2000000 nM3VV6-B00 3VV7-0B1 3VV8-B02 J Med Chem 2012 55:8838-58 J Med Chem 2007 50:5903-11 J Med Chem 2007 50:5912-25 2D 3D TSV
Set 961815/24190 - 190000 nM4FS4-H24 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:2444-9 J Med Chem 2007 50:5912-25 ACS Med Chem Lett 2012 3:897-902 J Med Chem 2013 56:3379-403 2D 3D TSV
Set 97518/18470 - 35000 nM3WB4-0B3 J Med Chem 2007 50:5912-25 2D 3D TSV
Set 982225/3340.0 - 5200 nM3L38-879 3L3A-625 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:2068-73 2D 3D TSV
Set 991615/2454000 - 2900000 nM3MSK-EV4 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:5329-33 2D 3D TSV
Set 1002120/267000 - 1000000 nM3MSL-EV5 3S2O-EV6 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:5329-33 2D 3D TSV
Set 1017821/4450.0 - 100000 nM3PI5-3P5 3QBH-QBH 3VF3-0GS 3VG1-0GT 4D83-0GT 4D85-0GU 4D88-BXQ 4D89-BXD 4D8C-BXD J Med Chem 2012 55:3364-86 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:1942-7 2D 3D TSV
Set 1021114/274000 - 1400000 nM3UDH-091 3UDJ-092 3UDK-095 3UDM-09A 3UDN-09B 3UDR-09F 3UDY-09G J Med Chem 2012 55:9069-88 2D 3D TSV
Set 1032328/33100 - 99000 nM4FM7-0UP 4FM8-0UQ J Med Chem 2012 55:9224-39 2D 3D TSV
Set 1041523/28170 - 640000 nM4HZT-0ZA Bioorg Med Chem Lett 2013 23:2181-6 2D 3D TSV
Set 105521/242800 - 640000 nM4I11-1CH Bioorg Med Chem Lett 2013 23:2181-6 2D 3D TSV
Set 1066725/337.50 - 360 nM5HDU-60W 5HDV-60V 5HDX-60U 5HDZ-954 5HE5-60S 5HE7-60X J Med Chem 2016 59:3231-48 US8541427 J Med Chem 2012 55:9331-45 US9145426 2D 3D TSV
Bifunctional protein (GlmU)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 1075619/3410.0 - 200000 nM3TWD-GOB 4AA7-R82 J Biol Chem 2011 286:40734-42 Eur J Med Chem 2015 92:78-90 2D 3D TSV
Bile acid receptor
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 10820822/374.00 - 35000 nM3DCT-064 3DCU-O62 3HC5-82X 3RUT-59G 3RUU-37G 3RVF-034 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:2969-73 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:4911-7 US10144729 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:1206-13 J Med Chem 2004 47:4559-69 Bioorg Med Chem 2007 15:2587-600 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:6154-60 US10183917 J Med Chem 2000 43:2971-4 Bioorg Med Chem Lett 2016 26:3746-53 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:4733-9 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:4339-43 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:2595-8 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:3962-6 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:3213-8 Bioorg Med Chem 2016 24:3986-3993 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:6848-53 Bioorg Med Chem 2013 21:4266-78 2D 3D TSV
Set 1095126/402.50 - 2900 nM3L1B-635 J Med Chem 2010 53:1774-87 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:1134-40 J Med Chem 2009 52:904-7 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:5289-92 2D 3D TSV
Biotin ligase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 110624/261200 - 12000 nM3V7R-32G US9108978 J Biol Chem 2012 287:17823-32 2D 3D TSV
Breakpoint cluster region protein /Tyrosine-protein kinase ABL
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 1117126/432.20 - 100000 nM2E2B-406 J Med Chem 2009 52:2265-79 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:2442-50 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:2712-7 Bioorg Med Chem 2013 22:623-32 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:3297-300 J Med Chem 2010 53:1413-37 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:4248-53 J Med Chem 2011 54:1347-55 Bioorg Med Chem 2013 21:3231-9 Chem Biol 2006 13:779-86 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:6964-8 US8703771 2D 3D TSV
Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 112920/26180 - 50000 nM4XUA-43C 4XUB-43D J Med Chem 2015 58:2553-9 2D 3D TSV
Set 1131918/25370 - 30000 nM4IR5-IR5 4IR6-IR6 4RVR-3WQ J Med Chem 2016 59:1410-24 J Med Chem 2016 59:3087-97 2D 3D TSV
Bromodomain-containing protein 4
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 1141921/32500 - 100000 nM2YEM-WSH J Med Chem 2013 56:7501-15 Bioorg Med Chem 2012 20:1878-86 2D 3D TSV
Set 115612/1224000 - 51000 nM4HXN-1A7 J Med Chem 2013 56:3833-51 2D 3D TSV
Set 1161519/30130 - 74000 nM4Z93-4LD J Med Chem 2015 58:4927-39 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:2968-72 2D 3D TSV
Set 1171319/29240 - 9200 nM5D24-L26 5D25-56M 5D3H-57G 5D3J-L33 5D3N-L40 5D3S-579 J Med Chem 2016 59:1518-30 2D 3D TSV
Set 1181515/27230 - 10000 nM4HXL-1A9 4HXM-1A8 4HXR-1A4 4HXS-1A3 J Med Chem 2013 56:3833-51 2D 3D TSV
Bromodomain-containing protein 9
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 1191421/317.90 - 5000 nM4UIT-N1D 4UIU-TVU J Med Chem 2016 59:1425-39 2D 3D TSV
Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 1203336/560.005 - 10000 nM3N7S-3N6 3N7R-3N6 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:2744-8 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:5684-8 J Med Chem 2014 57:7838-58 J Med Chem 2005 48:5921-31 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:1870-3 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:4723-7 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:4719-22 2D 3D TSV
Set 1215328/421.90 - 9900 nM3N7R-N7R J Med Chem 2007 50:5564-7 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:6368-72 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:2683-6 2D 3D TSV
CAM-RNase A
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 1223318/2727.0 - 840000 nM1JVU-C2P 1O0M-U2P 1O0N-U3P 1ROB-C2P 1RPF-C3P 1W4O-UA3 3D8Y-T3S 3DXH-UDP J Med Chem 2009 52:932-42 Eur J Med Chem 2009 44:4496-508 Bioorg Med Chem 2013 21:4634-45 Bioorg Med Chem 2010 18:8257-63 Bioorg Med Chem 2011 19:2478-84 Bioorg Med Chem 2009 17:4921-7 2D 3D TSV
cAMP and cAMP-inhibited cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase 10A
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 12315919/300.021 - 420 nM4PHW-2W1 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:919-24 US8759532 J Med Chem 2012 55:7299-331 2D 3D TSV
Set 1241822/320.056 - 690 nM4HF4-15H US8759532 J Med Chem 2012 55:7299-331 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:7371-5 2D 3D TSV
Set 1255624/360.024 - 1100 nM4ZO5-4Q0 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:4893-8 J Med Chem 2012 55:7299-331 US8846000 2D 3D TSV
Set 12615015/250.400 - 11000 nM2WEY-EV1 US8772316 US9200016 US9670181 Eur J Med Chem 2011 46:3986-95 2D 3D TSV
Set 1274415/2368.0 - 10000 nM4YQH-4F7 US9834564 US9592230 2D 3D TSV
Set 12813220/240.220 - 530 nM5EDH-5MF US9394311 US9617271 US9586970 2D 3D TSV
Set 1292518/370.080 - 2400 nM5AXP-4LK 5AXQ-4LK 5AXQ-4LP 5I2R-67A J Med Chem 2012 55:7299-331 Bioorg Med Chem 2015 23:7138-49 Bioorg Med Chem 2016 24:3447-55 US9579407 2D 3D TSV
Set 130927/300.056 - 6200 nM4HEU-15J J Med Chem 2012 55:7299-331 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:7371-5 2D 3D TSV
Set 131917/240.500 - 120 nM4P1R-2KR ACS Med Chem Lett 2014 5:700-5 2D 3D TSV
Set 132415/270.800 - 270 nM4P0N-1IR ACS Med Chem Lett 2014 5:700-5 2D 3D TSV
Set 1335420/310.800 - 16000 nM4DDL-0JQ Bioorg Med Chem Lett 2015 25:919-24 J Med Chem 2012 55:4776-87 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:2262-5 2D 3D TSV
Set 1345122/281.00 - 4000 nM4AEL-4HN Bioorg Med Chem Lett 2012 22:1944-8 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:2869-73 J Med Chem 2013 56:3228-34 2D 3D TSV
Set 1354115/2514.0 - 10000 nM2Y0J-AXC Bioorg Med Chem Lett 2011 21:3738-42 2D 3D TSV
Set 1363618/302.60 - 350000 nM4TPM-35E 4TPP-35D US8952037 Bioorg Med Chem 2015 22:6570-85 2D 3D TSV
cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 1378914/210.051 - 1000000 nM1OYN-4RR 1Q9M-4RR 1TBB-4RR Bioorg Med Chem 2010 18:2204-18 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:5241-6 Bioorg Med Chem Lett 1998 8:175-8 J Biol Chem 2012 287:11788-97 J Med Chem 1993 36:3274-7 Bioorg Med Chem Lett 1999 8:3229-34 Bioorg Med Chem Lett 1998 8:399-404 J Med Chem 2012 55:7525-45 J Med Chem 2007 50:344-9 J Med Chem 1989 32:1450-7 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:207-10 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:1323-7 Structure 2004 12:2233-47 2D 3D TSV
Set 1382021/331.00 - 3800 nM4WCU-3KQ J Med Chem 2014 57:5893-903 2D 3D TSV
Carbonic anhydrase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 1391719/25250 - 400000 nM3LXE-TOR Bioorg Med Chem Lett 2003 13:841-5 Chem Biol Drug Des 2009 74:317-21 J Med Chem 2003 46:2197-204 J Med Chem 2011 54:1481-9 2D 3D TSV
Set 140817/271.10 - 200000 nM4Q0L-V14 J Med Chem 2016 59:2083-93 J Med Chem 2014 57:9435-46 J Med Chem 2018 61:2292-2302 Bioorg Med Chem 2013 21:2093-106 2D 3D TSV
Set 141516/20500 - 2600 nM4KP5-E1F J Med Chem 2016 59:2083-93 J Med Chem 2018 61:2292-2302 2D 3D TSV
Carbonic anhydrase 1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 142811/1262.0 - 79000000 nM2NN1-M28 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:2377-81 J Med Chem 2002 45:312-20 J Med Chem 2013 56:1761-71 Bioorg Med Chem 2013 21:1522-5 2D 3D TSV
Set 1432113/200.050 - 9100 nM4WUQ-3UG J Med Chem 2016 59:2083-93 J Med Chem 2006 49:5544-51 J Med Chem 2002 45:312-20 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:3170-3 J Med Chem 2003 46:2187-96 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:1551-7 Bioorg Med Chem 2013 21:2093-106 J Med Chem 2004 47:2796-804 J Med Chem 1999 42:3690-700 2D 3D TSV
Set 1441614/180.050 - 30000 nM4WR7-3TV J Med Chem 2000 43:3677-87 Bioorg Med Chem 2013 21:2093-106 2D 3D TSV
Set 145510/144.50 - 40000 nM4WUP-3UF Bioorg Med Chem 2013 21:2093-106 2D 3D TSV
Carbonic anhydrase 12
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 146510/1440.0 - 13000 nM4WW8-VD9 Bioorg Med Chem 2013 21:2093-106 2D 3D TSV
Carbonic anhydrase 2
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 1472310/124.00 - 320000 nM1ZGE-SDA J Med Chem 2006 49:5544-51 J Med Chem 2007 50:381-8 J Med Chem 2000 43:4542-51 Bioorg Med Chem Lett 2010 21:141-4 J Med Chem 1986 29:1488-94 Bioorg Med Chem 2013 21:1522-5 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:2273-6 J Med Chem 2000 43:3677-87 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3089-93 J Med Chem 2013 56:1761-71 J Med Chem 2003 46:2187-96 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:447-53 J Med Chem 2005 48:2121-5 J Med Chem 1999 42:3690-700 2D 3D TSV
Set 1481611/159.00 - 320000 nM3V5G-0F3 J Med Chem 2004 47:1272-9 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:2273-6 J Med Chem 2007 50:381-8 J Med Chem 2012 55:6776-83 J Med Chem 2000 43:3677-87 J Med Chem 2000 43:4542-51 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4862-6 Bioorg Med Chem Lett 2010 21:141-4 Bioorg Med Chem 2013 21:1522-5 Bioorg Med Chem 2013 21:1555-63 2D 3D TSV
Set 1491711/140.001 - 430000 nM2NNO-M28 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:2377-81 J Med Chem 2002 45:312-20 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3089-93 J Med Chem 2013 56:1761-71 Bioorg Med Chem Lett 2010 21:141-4 J Med Chem 1991 34:3098-105 Bioorg Med Chem 2013 21:1522-5 2D 3D TSV
Set 1503312/230.001 - 160000 nM2QO8-3CC 2QOA-MAJ J Med Chem 2002 45:312-20 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3089-93 J Med Chem 2011 54:3977-81 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:1551-7 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:5781-6 J Med Chem 2006 49:2743-9 Bioorg Med Chem 2017 25:1666-1671 Biochem Biophys Res Commun 2003 305:909-14 Bioorg Med Chem Lett 2010 21:141-4 J Med Chem 1991 34:3098-105 Bioorg Med Chem 2013 21:1522-5 2D 3D TSV
Set 1513911/140.400 - 19000 nM3DAZ-MZM J Med Chem 2006 49:5544-51 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:575-82 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:2351-6 J Med Chem 2000 43:4542-51 J Med Chem 2004 47:2796-804 J Med Chem 2004 47:1272-9 J Med Chem 1999 42:2641-50 J Med Chem 2002 45:312-20 J Med Chem 2013 56:1761-71 J Med Chem 1992 35:2697-703 28511911Bioorg Med Chem Lett 2002 12:1551-7 J Med Chem 2000 43:292-300 J Med Chem 1999 42:3690-700 J Med Chem 2002 45:1466-76 2D 3D TSV
Set 1529018/240.200 - 9000 nM2HOC-1CN 3NI5-C1H J Med Chem 2016 59:5077-88 J Enzyme Inhib Med Chem 2009 24:499-505 J Med Chem 2000 43:4542-51 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:2867-73 J Med Chem 2004 47:2796-804 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:3216-21 J Med Chem 2004 47:1272-9 Bioorg Med Chem Lett 2000 10:1117-20 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:3302-6 J Med Chem 2004 47:2337-47 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:2685-91 J Med Chem 2002 45:312-20 J Med Chem 2012 55:6776-83 J Enzyme Inhib Med Chem 2004 19:269-73 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:5775-80 J Med Chem 2013 56:1761-71 J Med Chem 2003 46:2187-96 Bioorg Med Chem Lett 2000 10:673-6 Eur J Med Chem 2015 92:156-77 J Med Chem 2006 49:2117-26 J Med Chem 2000 43:292-300 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4862-6 J Med Chem 1999 42:3690-700 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:4376-81 2D 3D TSV
Set 15310213/140.300 - 30000 nM1ZFQ-ZEC 3S73-EVF Bioorg Med Chem Lett 2004 14:5703-7 J Med Chem 1989 32:2486-92 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:575-82 J Med Chem 2000 43:4542-51 Bioorg Med Chem 2015 23:1828-40 J Med Chem 2002 45:312-20 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3089-93 Bioorg Med Chem 2013 21:2093-106 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:1551-7 J Med Chem 2000 43:292-300 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:971-6 J Med Chem 1999 42:3690-700 J Med Chem 2002 45:1466-76 2D 3D TSV
Set 1547812/250.500 - 36000 nM3MHC-ARZ 4IWZ-1GO J Med Chem 2002 45:312-20 J Med Chem 2016 59:5077-88 J Med Chem 1992 35:2697-703 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:1551-7 J Med Chem 2000 43:4542-51 Bioorg Med Chem 2013 21:2314-8 J Med Chem 2006 49:5544-51 Bioorg Med Chem Lett 2004 15:367-72 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:575-82 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:3170-3 Bioorg Med Chem 2016 24:3548-55 J Med Chem 1986 29:1488-94 Bioorg Med Chem Lett 2000 10:1117-20 Chem Biol Drug Des 2009 74:317-21 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:1787-91 J Med Chem 2006 49:2117-26 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:836-41 J Med Chem 1999 42:3690-700 J Med Chem 2002 45:1466-76 2D 3D TSV
Set 1554413/200.140 - 9000 nM1CIM-PTS 1CIN-MTS J Med Chem 2015 58:2821-33 J Enzyme Inhib Med Chem 2009 24:499-505 J Med Chem 1987 30:591-7 J Med Chem 1994 37:1035-54 J Med Chem 1989 32:2510-3 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:6565-70 Bioorg Med Chem Lett 2000 10:1117-20 J Med Chem 1999 42:2641-50 J Med Chem 2013 56:1761-71 J Med Chem 1994 37:240-7 Bioorg Med Chem Lett 2000 10:673-6 Chem Biol Drug Des 2009 74:636-9 J Med Chem 1991 34:3098-105 J Med Chem 1999 42:3690-700 2D 3D TSV
Set 1562819/2210.0 - 25000 nM1EOU-SMS Bioorg Med Chem Lett 2003 13:841-5 J Med Chem 2008 51:2518-21 Chem Biol Drug Des 2009 74:317-21 J Med Chem 2003 46:2197-204 J Med Chem 2013 56:1761-71 J Med Chem 2006 49:3496-500 Bioorg Med Chem 2013 21:1419-26 J Med Chem 2011 54:1481-9 2D 3D TSV
Set 15714412/201.50 - 10000 nM2HD6-BOS 3OYS-OYS 3R16-5UN 3R17-5UM Bioorg Med Chem 2014 22:3982-8 J Med Chem 2011 54:1896-902 J Med Chem 2006 49:5544-51 Bioorg Med Chem Lett 2004 15:367-72 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:3170-3 J Med Chem 2011 54:3977-81 Bioorg Med Chem 2016 24:982-8 J Med Chem 2000 43:4542-51 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:3496-9 J Med Chem 2004 47:2796-804 Eur J Med Chem 2016 110:259-66 Bioorg Med Chem 2013 21:1396-403 J Med Chem 2008 51:3051-6 Bioorg Med Chem 2014 22:2867-74 J Med Chem 2000 43:3677-87 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:5185-9 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:1787-91 J Med Chem 2006 49:2117-26 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4862-6 J Med Chem 1999 42:3690-700 J Med Chem 2017 60:2456-2469 J Med Chem 2016 59:5077-88 J Med Chem 2002 45:312-20 J Med Chem 2003 46:2187-96 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:1551-7 Eur J Med Chem 2017 127:691-702 J Med Chem 2002 45:1466-76 Bioorg Med Chem 2011 19:3732-8 J Med Chem 2004 47:1272-9 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3089-93 Bioorg Med Chem 2013 21:1555-63 2D 3D TSV
Set 15813113/260.210 - 10000 nM3V7X-D7A 4ITP-1GD 4Z1J-4KC 4Z1K-4KB 4Z1N-4KD J Enzyme Inhib Med Chem 2013 28:289-93 Bioorg Med Chem 2010 18:5081-9 J Am Chem Soc 2006 128:3011-8 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:3170-3 Bioorg Med Chem 2015 23:5311-8 J Med Chem 2008 51:3051-6 Bioorg Med Chem 2014 22:2867-74 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:2377-81 J Med Chem 1994 37:2100-5 Eur J Med Chem 2015 102:223-32 J Med Chem 2012 55:3891-9 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:1787-91 J Med Chem 2006 49:2117-26 J Med Chem 2017 60:4316-4326 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:575-82 J Med Chem 2006 49:6539-48 Bioorg Med Chem 2015 22:6768-75 Bioorg Med Chem 2015 23:2975-81 J Med Chem 2002 45:312-20 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:5185-9 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:1551-7 J Med Chem 1999 42:3690-700 J Med Chem 2002 45:1466-76 Eur J Med Chem 2017 127:691-702 J Med Chem 2011 54:3977-81 ACS Med Chem Lett 2014 5:826-30 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:3496-9 Bioorg Med Chem 2017 25:1666-1671 J Med Chem 2004 47:1272-9 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3089-93 J Med Chem 2009 52:4853-9 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:836-41 2D 3D TSV
Set 15913313/203.60 - 4600 nM3OY0-OY0 J Med Chem 2011 54:1896-902 Bioorg Med Chem Lett 2004 15:367-72 J Med Chem 2016 59:5077-88 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:575-82 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:3170-3 Bioorg Med Chem 2013 21:1396-403 J Med Chem 2002 45:312-20 J Med Chem 2003 46:2187-96 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:5185-9 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:1551-7 J Med Chem 1999 42:3690-700 Eur J Med Chem 2017 127:691-702 J Med Chem 2002 45:1466-76 J Med Chem 2006 49:5544-51 Chembiochem 2009 10:838-43 J Med Chem 2011 54:3977-81 ACS Med Chem Lett 2014 5:826-30 J Med Chem 2004 47:1272-9 Bioorg Med Chem 2009 17:553-7 J Med Chem 2000 43:3677-87 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3089-93 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:836-41 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4862-6 J Med Chem 2017 60:2456-2469 Bioorg Med Chem 2013 21:1555-63 2D 3D TSV
Set 1601516/2224.0 - 12000 nM3NB5-R21 J Med Chem 2006 49:5544-51 J Med Chem 2002 45:312-20 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3089-93 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:3170-3 J Med Chem 2011 54:3977-81 ACS Med Chem Lett 2014 5:826-30 J Med Chem 2011 54:1682-92 Bioorg Med Chem 2017 25:1666-1671 J Med Chem 1999 42:3690-700 2D 3D TSV
Set 1612911/163.90 - 190 nM4RFC-3O1 4RUY-3W6 4RUZ-3W8 J Med Chem 2014 57:9673-86 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:3216-21 Bioorg Med Chem 2015 23:1828-40 J Med Chem 2000 43:3677-87 J Med Chem 2013 56:1761-71 J Med Chem 2002 45:3588-602 2D 3D TSV
Set 1622411/133.90 - 190 nM4RUX-3W3 J Med Chem 2014 57:9673-86 J Med Chem 2000 43:3677-87 J Med Chem 2013 56:1761-71 J Med Chem 2002 45:3588-602 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:3216-21 Bioorg Med Chem 2015 23:1828-40 2D 3D TSV
Set 1632314/190.800 - 42.0 nM4PZH-V13 4WW6-3TV Bioorg Med Chem 2013 21:2093-106 J Med Chem 1991 34:3098-105 J Med Chem 2000 43:3677-87 2D 3D TSV
Set 1643219/300.080 - 5.58 nM1I8Z-INL 1I91-INQ Bioorg Med Chem 2000 8:957-75 Protein Sci 1998 7:2483-9 2D 3D TSV
Set 1651421/325.00 - 1500 nM2GD8-PO1 2X7S-WZC 2X7T-WZB 3BET-CTF J Med Chem 2003 46:2197-204 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:863-5 Biochem Biophys Res Commun 2003 305:909-14 J Med Chem 2010 53:2155-70 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:579-84 J Med Chem 2008 51:1295-308 2D 3D TSV
Set 1661717/218.00 - 6800 nM1ZE8-PIU Bioorg Med Chem 2013 21:1564-9 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:869-73 2D 3D TSV
Set 167922/2568.0 - 300000 nM2H15-B19 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:841-5 J Med Chem 2008 51:2518-21 J Med Chem 2006 49:3496-500 2D 3D TSV
Set 1681212/1947.0 - 860 nM5BYI-4WA Bioorg Med Chem Lett 2009 19:2273-6 Chem Biol Drug Des 2009 74:196-202 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:4929-32 2D 3D TSV
Set 1691817/211.00 - 650 nM4DZ7-D02 ACS Med Chem Lett 2014 5:927-30 J Med Chem 2016 59:10692-10704 2D 3D TSV
Set 1706512/210.300 - 9600 nM3MZC-S6I 3N3J-WWV J Med Chem 2011 54:1896-902 Bioorg Med Chem Lett 2004 15:367-72 28522267J Med Chem 2000 43:4884-92 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:3850-3 Bioorg Med Chem 2015 22:6768-75 Eur J Med Chem 2016 110:259-66 J Med Chem 2004 47:1272-9 Bioorg Med Chem 2017 25:2569-2576 ACS Med Chem Lett 2015 6:518-22 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:3821-7 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4862-6 J Med Chem 2017 60:2456-2469 2D 3D TSV
Set 1712915/250.930 - 5000 nM3N0N-P9B J Med Chem 2011 54:1896-902 Bioorg Med Chem 2017 25:2569-2576 28522267ACS Med Chem Lett 2015 6:518-22 J Med Chem 2004 47:2796-804 Eur J Med Chem 2016 110:259-66 2D 3D TSV
Set 1722119/230.300 - 9600 nM3N2P-AYX J Med Chem 2011 54:1896-902 Bioorg Med Chem 2017 25:2569-2576 28522267ACS Med Chem Lett 2015 6:518-22 Bioorg Med Chem 2013 21:1404-9 Eur J Med Chem 2016 110:259-66 2D 3D TSV
Set 173349/11470 - 11000000 nM4E3D-GTQ 4E3F-GRE Bioorg Med Chem 2008 16:9101-5 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:3593-6 Bioorg Med Chem 2013 21:1564-9 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:2521-6 Bioorg Med Chem 2010 18:2159-64 Bioorg Med Chem 2011 19:1381-9 Bioorg Med Chem 2009 17:2654-7 2D 3D TSV
Set 1743122/230.880 - 60.5 nM3B4F-TUO J Med Chem 2009 52:4063-7 Bioorg Med Chem 2008 16:9113-20 2D 3D TSV
Set 17587/8540 - 750000 nM4E3H-HQE Bioorg Med Chem Lett 2008 18:3593-6 Bioorg Med Chem 2010 18:2159-64 Bioorg Med Chem 2013 21:1489-94 Bioorg Med Chem 2011 19:1381-9 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:4259-62 Bioorg Med Chem 2017 25:2577-2582 2D 3D TSV
Set 1765012/156500 - 6000000 nM4CQ0-SXS 5CLU-S8A Bioorg Med Chem 2016 24:1095-105 Bioorg Med Chem 2017 25:3583-3589 J Enzyme Inhib Med Chem 2014 29:118-23 Bioorg Med Chem 2013 21:1522-5 J Med Chem 2014 57:3522-31 2D 3D TSV
Set 177218/154.70 - 10000 nM3IBI-BOW 3IBL-O59 3IBN-O60 3IBU-O48 J Med Chem 2003 46:5471-7 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:579-84 Bioorg Med Chem 2013 21:1410-8 J Med Chem 2003 46:2197-204 2D 3D TSV
Set 178711/11520 - 540000 nM5BNL-2HC Bioorg Med Chem 2013 21:1564-9 Bioorg Med Chem 2010 18:2159-64 2D 3D TSV
Set 17913110/250.001 - 9100000 nM1IF4-FBS 2WEJ-FB2 3T5U-A09 4YX4-FB2 4YXO-4JC 4YXU-4JE 5E28-BC5 5E2K-BX4 5E2R-520 5E2S-5CX J Med Chem 2000 43:3677-87 J Med Chem 2013 56:1761-71 Bioorg Med Chem 2013 21:2093-106 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:5703-7 J Med Chem 2007 50:381-8 Chembiochem 2009 10:838-43 J Med Chem 2008 51:1945-53 J Med Chem 2012 55:3513-20 Bioorg Med Chem Lett 2010 21:141-4 J Med Chem 1986 29:1488-94 Bioorg Med Chem 2013 21:1522-5 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:1005-9 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:1352-7 Chem Biol Drug Des 2009 74:196-202 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:3170-3 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:5892-6 Eur J Med Chem 2012 51:259-70 Bioorg Med Chem 2014 22:2867-74 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:2377-81 J Med Chem 2002 45:312-20 J Med Chem 2012 55:6776-83 J Med Chem 1994 37:2100-5 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:3821-7 J Med Chem 2006 49:2117-26 Bioorg Med Chem 2012 20:2392-404 J Med Chem 1991 34:3098-105 J Med Chem 1999 42:3690-700 J Med Chem 2016 59:721-32 Eur J Med Chem 2017 127:691-702 J Med Chem 2002 45:1466-76 J Med Chem 2006 49:5544-51 J Med Chem 2015 58:8564-72 Bioorg Med Chem 2007 15:4336-50 J Med Chem 2011 54:3977-81 J Med Chem 2000 43:4542-51 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:5781-6 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:3102-8 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:3496-9 Bioorg Med Chem 2014 22:5883-90 J Med Chem 2004 47:1272-9 Bioorg Med Chem 2017 25:1260-1265 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3089-93 J Med Chem 2009 52:4853-9 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:715-9 J Enzyme Inhib Med Chem 2009 24:499-505 2D 3D TSV
Set 1801216/228.80 - 2200 nM3VBD-0FZ Bioorg Med Chem 2014 22:2867-74 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:2377-81 J Med Chem 2012 55:3891-9 Bioorg Med Chem 2014 22:5883-90 2D 3D TSV
Set 1813020/574.60 - 20000 nM3HKN-MFS 3HKQ-1SD J Med Chem 2009 52:6421-32 J Med Chem 2010 53:2913-26 J Med Chem 2015 58:7580-90 J Med Chem 2014 57:8635-45 2D 3D TSV
Set 182623/2319.0 - 40.0 nM4KUV-MB6 4KUW-MB2 J Med Chem 2014 57:9152-67 2D 3D TSV
Set 183822/2412.0 - 40.0 nM1ZFK-NR2 4KUY-MB4 4KV0-MB7 Bioorg Med Chem 2007 15:4336-50 J Med Chem 2014 57:9152-67 Bioorg Med Chem 2013 21:1555-63 2D 3D TSV
Set 184816/250.590 - 200000 nM4PYX-V90 J Med Chem 2016 59:2083-93 J Med Chem 2014 57:9435-46 J Med Chem 2018 61:2292-2302 Bioorg Med Chem 2013 21:2093-106 2D 3D TSV
Set 185615/225.70 - 10000 nM4Z0Q-4K9 Bioorg Med Chem 2015 23:2975-81 Eur J Med Chem 2015 102:223-32 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:1787-91 2D 3D TSV
Set 186139/1090.0 - 200000 nM3M2Y-BE0 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:837-40 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:2353-8 Bioorg Med Chem 2013 21:1410-8 2D 3D TSV
Set 1872017/277.00 - 220 nM2HL4-BO1 Bioorg Med Chem Lett 2003 14:225-9 Bioorg Med Chem 2011 19:1172-8 Chem Biol Drug Des 2009 74:636-9 Bioorg Med Chem 2012 20:2392-404 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:2178-82 2D 3D TSV
Set 188911/12100000 - 200000 nM4WL4-FC5 J Med Chem 2016 59:462-73 Bioorg Med Chem 2012 20:2266-73 2D 3D TSV
Set 1892017/2318.0 - 560 nM3MMF-D9H 3MNA-DWH Bioorg Med Chem 2011 19:3105-19 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:5427-33 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:3102-8 Bioorg Med Chem 2013 21:1555-63 2D 3D TSV
Set 1902815/2426.0 - 1800 nM3M67-E36 3S9T-E49 3SAX-E50 3SBH-E65 4QSI-EWZ Bioorg Med Chem 2010 18:7357-64 Eur J Med Chem 2012 51:259-70 J Med Chem 2018 61:2292-2302 2D 3D TSV
Set 1912215/2326.0 - 520 nM3S8X-E59 3SAP-E2I J Med Chem 2018 61:2292-2302 Eur J Med Chem 2012 51:259-70 2D 3D TSV
Set 192715/153700 - 130000 nM5FDC-5WN J Med Chem 2009 52:7528-36 2D 3D TSV
Set 193517/2712.0 - 79.0 nM3ML2-SU0 Bioorg Med Chem 2010 18:4873-8 2D 3D TSV
Set 194517/2116.0 - 200 nM3MHI-J90 3MHL-J71 3MHM-J75 Bioorg Med Chem 2010 18:7413-21 2D 3D TSV
Set 195522/2316.0 - 210 nM3QYK-IE2 J Med Chem 2012 55:9619-29 2D 3D TSV
Set 1962613/132.60 - 100 nM3S74-03T J Med Chem 1989 32:2548-54 J Med Chem 1990 33:749-54 2D 3D TSV
Set 1971213/133.00 - 210 nM3S71-EVD J Med Chem 1990 33:749-54 2D 3D TSV
Set 198108/914000 - 10000000 nM4Q7P-3MH 4Q7S-2YU 4Q7V-5MH 4Q7W-6MH J Med Chem 2014 57:7126-35 2D 3D TSV
Carbonic anhydrase 4
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 1991819/2523.0 - 5000 nM3F7B-AG5 3F7U-AG4 Bioorg Med Chem 2010 18:3307-19 2D 3D TSV
Carbonic Anhydrase II Mutant (F131V)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2001120/231.60 - 5.60 nM1G45-FSB 1G46-F2B 1G48-F6B 1G4J-FFB 1G4O-BSB 1I9L-INV 1I9M-INW 1I9N-IOA 1I9O-IOC 1I9P-IOE 1I9Q-IOF J Am Chem Soc 2001 123:9620-7 2D 3D TSV
Carbonic Anhydrase XIV
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2012016/250.410 - 16.0 nM5CJF-520 J Med Chem 2015 58:8564-72 2D 3D TSV
Carbonic anhydrases; II & IX
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2021611/168.99 - 290000 nM2POU-I7A 2POV-I7B Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3089-93 J Med Chem 2013 56:1761-71 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:447-53 J Med Chem 1986 29:1488-94 Bioorg Med Chem 2013 21:1522-5 J Med Chem 2002 45:312-20 J Med Chem 2000 43:4542-51 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4862-6 J Med Chem 1999 42:3690-700 J Med Chem 2002 45:1466-76 2D 3D TSV
Set 203510/109.00 - 36000 nM2HNC-1SA Bioorg Med Chem 2016 24:3612-7 J Med Chem 2015 58:1494-501 Bioorg Med Chem 2013 21:2314-8 J Med Chem 1999 42:3690-700 2D 3D TSV
Set 2049413/190.200 - 7900 nM3D8W-3DB J Med Chem 2016 59:5077-88 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:4376-81 J Enzyme Inhib Med Chem 2009 24:499-505 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:2347-52 J Med Chem 2000 43:4542-51 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:2867-73 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:2975-9 J Med Chem 2004 47:2796-804 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:3216-21 J Med Chem 2004 47:1272-9 Bioorg Med Chem Lett 2000 10:1117-20 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:3302-6 J Med Chem 2004 47:2337-47 J Med Chem 2002 45:312-20 J Med Chem 2012 55:6776-83 J Enzyme Inhib Med Chem 2004 19:269-73 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:5775-80 J Med Chem 2013 56:1761-71 J Med Chem 2003 46:2187-96 Eur J Med Chem 2015 92:156-77 J Med Chem 2006 49:2117-26 J Med Chem 2000 43:292-300 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4862-6 J Med Chem 1999 42:3690-700 2D 3D TSV
Set 2055111/1240.0 - 78000 nM2Q1B-LSA 2Q38-LSA Bioorg Med Chem 2016 24:1095-105 Bioorg Med Chem 2017 25:3583-3589 J Med Chem 2013 56:1761-71 J Enzyme Inhib Med Chem 2014 29:118-23 J Med Chem 2006 49:2117-26 J Med Chem 2005 48:2121-5 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4862-6 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:3422-5 J Med Chem 2014 57:3522-31 2D 3D TSV
Set 2069813/160.300 - 30000 nM3DD0-EZL 3CAJ-EZL Bioorg Med Chem Lett 2004 14:5703-7 J Med Chem 1989 32:2486-92 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:575-82 J Med Chem 2000 43:4542-51 Bioorg Med Chem 2015 23:1828-40 J Med Chem 1999 42:2641-50 J Med Chem 2002 45:312-20 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3089-93 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:1551-7 J Med Chem 2000 43:292-300 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:971-6 J Med Chem 1999 42:3690-700 J Med Chem 2002 45:1466-76 2D 3D TSV
Set 2074214/210.140 - 160 nM1CIL-ETS J Med Chem 2015 58:2821-33 J Enzyme Inhib Med Chem 2009 24:499-505 J Med Chem 1987 30:591-7 J Med Chem 1994 37:1035-54 J Med Chem 1989 32:2510-3 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:6565-70 Bioorg Med Chem Lett 2000 10:1117-20 J Med Chem 1999 42:2641-50 J Med Chem 1994 37:240-7 Bioorg Med Chem Lett 2000 10:673-6 Chem Biol Drug Des 2009 74:636-9 J Med Chem 1991 34:3098-105 J Med Chem 1999 42:3690-700 2D 3D TSV
Set 2082719/2510.0 - 13000 nM3HKU-TOR Bioorg Med Chem Lett 2003 13:841-5 J Med Chem 2008 51:2518-21 Chem Biol Drug Des 2009 74:317-21 J Med Chem 2003 46:2197-204 J Med Chem 2006 49:3496-500 Bioorg Med Chem 2013 21:1419-26 J Med Chem 2011 54:1481-9 2D 3D TSV
Set 2096713/210.300 - 9600 nM3N4B-WWZ J Med Chem 2011 54:1896-902 J Med Chem 2006 49:5544-51 ACS Med Chem Lett 2014 5:793-6 Bioorg Med Chem 2007 15:4336-50 J Med Chem 2011 54:3977-81 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:3850-3 J Med Chem 2004 47:2796-804 Eur J Med Chem 2016 110:259-66 Bioorg Med Chem 2013 21:1396-403 Bioorg Med Chem 2017 25:2569-2576 J Med Chem 2000 43:3677-87 ACS Med Chem Lett 2015 6:518-22 J Med Chem 2003 46:2187-96 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4862-6 J Med Chem 1999 42:3690-700 J Med Chem 2017 60:2456-2469 2D 3D TSV
Set 2102216/238.90 - 100000 nM1OQ5-CEL J Med Chem 2002 45:3588-602 J Med Chem 2004 47:550-7 Bioorg Med Chem 2013 21:1451-64 2D 3D TSV
Set 2114118/232.70 - 17000 nM3M98-E02 J Med Chem 2016 59:2083-93 Bioorg Med Chem 2010 18:7357-64 J Med Chem 2018 61:2292-2302 J Enzyme Inhib Med Chem 2014 29:124-31 2D 3D TSV
Set 21214110/130.001 - 1100000 nM2NNG-ZYX 4YXI-4J8 4YYT-S2O Bioorg Med Chem Lett 2009 19:3170-3 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:5892-6 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:5427-33 Bioorg Med Chem Lett 2010 21:141-4 Bioorg Med Chem Lett 2000 10:1117-20 J Med Chem 2008 51:3051-6 Bioorg Med Chem 2014 22:2867-74 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:2377-81 J Med Chem 2002 45:312-20 J Med Chem 2012 55:6776-83 J Med Chem 1994 37:2100-5 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:1551-7 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:3821-7 J Med Chem 2006 49:2117-26 Bioorg Med Chem 2012 20:2392-404 J Med Chem 1991 34:3098-105 J Med Chem 1999 42:3690-700 J Med Chem 2016 59:721-32 Eur J Med Chem 2017 127:691-702 J Med Chem 2002 45:1466-76 J Med Chem 2006 49:5544-51 Bioorg Med Chem 2010 18:5081-9 J Med Chem 2015 58:8564-72 J Med Chem 2008 51:1945-53 J Med Chem 2012 55:3513-20 Bioorg Med Chem 2007 15:4336-50 J Med Chem 2011 54:3977-81 J Enzyme Inhib Med Chem 2009 24:499-505 ACS Med Chem Lett 2014 5:826-30 J Med Chem 2000 43:4542-51 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:5781-6 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:3102-8 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:3496-9 Bioorg Med Chem 2017 25:1666-1671 Bioorg Med Chem 2013 21:1522-5 Bioorg Med Chem 2014 22:5883-90 J Med Chem 2004 47:1272-9 J Med Chem 2000 43:3677-87 Bioorg Med Chem 2017 25:1260-1265 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3089-93 J Med Chem 2009 52:4853-9 J Med Chem 2013 56:1761-71 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:715-9 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4862-6 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:6014-7 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:2521-6 Bioorg Med Chem 2013 21:2093-106 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:3422-5 Bioorg Med Chem 2010 18:4468-74 Bioorg Med Chem 2015 23:7353-8 Bioorg Med Chem 2013 21:1555-63 2D 3D TSV
Set 213917/270.590 - 200000 nM4PYY-V14 J Med Chem 2016 59:2083-93 J Med Chem 2014 57:9435-46 J Med Chem 2018 61:2292-2302 Bioorg Med Chem 2013 21:2093-106 2D 3D TSV
Set 2141915/2026.0 - 520 nM3SBI-E90 4KNJ-E1F J Med Chem 2018 61:2292-2302 Eur J Med Chem 2012 51:259-70 Bioorg Med Chem 2010 18:7357-64 2D 3D TSV
Carboxypeptidase B
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 21579/122.60 - 30000 nM3WAB-DDW Bioorg Med Chem Lett 2007 17:1349-54 J Med Chem 2012 55:7696-705 2D 3D TSV
Casein kinase I isoform delta
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2161417/2815.0 - 4900 nM4HGT-15G ACS Med Chem Lett 2012 3:1059-1064 2D 3D TSV
Set 217519/2442.0 - 550 nM4KB8-1QN 4KBK-1QG J Med Chem 2013 56:6819-28 2D 3D TSV
Set 2181517/19500 - 81000 nM5IH5-AUE 5IH6-AUG Nat Biotechnol 2011 29:1046-51 Cell Chem Biol 2016 23:494-507 2D 3D TSV
Caspase-1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 219723/375.00 - 2100 nM1RWM-Q2Y 1RWW-OQB Bioorg Med Chem Lett 2005 16:559-62 J Med Chem 2008 51:3661-80 2D 3D TSV
Caspase-3
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2202831/400.005 - 9400 nM1RHR-CNE Bioorg Med Chem Lett 2005 15:1173-80 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:805-8 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:3886-90 2D 3D TSV
Set 221817/181100 - 97000 nM1RE1-NA3 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:2137-40 2D 3D TSV
Set 222535/3926.0 - 200 nM1RHU-3CY Bioorg Med Chem Lett 2002 12:2197-200 2D 3D TSV
Catechol-O-methyltransferase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 223712/1316.0 - 700000 nM3S68-TCW 4PYL-TCW J Med Chem 1989 32:841-6 J Med Chem 2005 48:8070-8 2D 3D TSV
Cathepsin (B and K)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 224614/14140000 - 430000 nM3AI8-HNQ J Med Chem 2013 56:521-33 2D 3D TSV
Cathepsin A (CTSA)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2253326/373.00 - 30000 nM4AZ0-S61 4AZ3-S35 J Med Chem 2012 55:7636-49 2D 3D TSV
Cathepsin B
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2261621/3723.0 - 68000 nM2DC6-73V 2DC9-74M 2DCA-75V 2DCC-77B 2DCD-78A J Mol Biol 2006 362:979-93 J Nat Prod 2014 77:1749-52 2D 3D TSV
Set 227716/2223.0 - 15000 nM2DC8-59A J Mol Biol 2006 362:979-93 2D 3D TSV
Cathepsin D
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 22824016/408.60 - 29000 nM4OBZ-2S4 4OD9-2RZ US9884814 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:4141-50 2D 3D TSV
Set 229940/530.700 - 5000 nM4OC6-2S1 J Med Chem 2000 43:305-41 J Med Chem 2002 45:1412-9 J Med Chem 1999 42:1428-40 Chem Biol 1997 4:297-307 2D 3D TSV
Cathepsin G
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 230827/4538.0 - 1300 nM1KYN-KTP 1T32-OHH J Med Chem 2004 47:769-87 J Med Chem 2007 50:1727-30 2D 3D TSV
Cathepsin K
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2311418/230.015 - 990 nM4X6H-I37 4X6I-3Y1 J Med Chem 2003 46:3709-27 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:1486-90 J Med Chem 2012 55:8827-37 J Med Chem 2015 58:6928-37 J Med Chem 2008 51:4359-69 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4741-4 2D 3D TSV
Set 2322825/303.00 - 100000 nM4DMX-0LB J Med Chem 2012 55:8827-37 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:2899-903 J Med Chem 2012 55:6363-74 2D 3D TSV
Set 2337417/260.064 - 16000 nM1SNK-MYE J Med Chem 2002 45:2352-4 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:2887-91 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:2549-54 J Med Chem 2001 44:1380-95 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:195-8 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:199-202 J Med Chem 2011 54:396-400 J Med Chem 2001 44:94-104 J Med Chem 2013 56:1478-90 J Med Chem 1998 41:3563-7 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:1997-2001 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:2051-3 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:3425-9 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:3988-91 J Med Chem 1998 41:3923-7 J Med Chem 2001 44:725-36 J Med Chem 2005 48:6870-8 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:719-22 Bioorg Med Chem Lett 2003 14:87-90 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:1502-5 J Med Chem 2005 48:7688-707 Bioorg Med Chem Lett 2002 13:139-41 2D 3D TSV
Set 2344130/390.010 - 10000 nM1NLJ-2CA J Med Chem 2005 48:6870-8 J Med Chem 2001 44:1380-95 J Med Chem 2006 49:1597-612 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:923-8 J Med Chem 2013 56:1478-90 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:4409-15 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:675-9 2D 3D TSV
Set 2354113/180.560 - 100000 nM1Q6K-TCO Bioorg Med Chem Lett 2003 14:275-8 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:719-22 Eur J Med Chem 2010 45:667-81 Bioorg Med Chem 2008 16:1562-95 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:1815-9 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:3425-9 J Med Chem 2005 48:7688-707 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:978-83 2D 3D TSV
Set 2362815/240.130 - 710 nM2AUX-CT1 2AUZ-CT2 Eur J Med Chem 2010 45:667-81 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:1815-9 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:3425-9 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:978-83 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:4897-902 Bioorg Med Chem Lett 2003 14:275-8 2D 3D TSV
Set 2376122/280.210 - 4900 nM1TU6-FSP Bioorg Med Chem Lett 2006 16:1735-9 J Med Chem 2004 47:5049-56 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:3540-6 Eur J Med Chem 2010 45:667-81 J Med Chem 2004 47:588-99 J Med Chem 2013 56:1478-90 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:4897-902 2D 3D TSV
Set 2381332/370.646 - 460000 nM1YT7-3FC Bioorg Med Chem Lett 2005 15:3540-6 Eur J Med Chem 2010 45:667-81 2D 3D TSV
Set 239516/1823.0 - 80.0 nM3KW9-ORG Eur J Med Chem 2016 121:12-20 2D 3D TSV
Set 2405417/321.00 - 4100 nM3KWZ-KWZ 3O1G-O75 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:4447-50 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:6237-41 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:1524-7 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:6890-4 2D 3D TSV
Set 2412319/2838.0 - 12000 nM3KWB-ORH Bioorg Med Chem Lett 2010 20:1488-90 2D 3D TSV
Set 2421121/3011.5 - 10000 nM3OVZ-O96 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:6890-4 2D 3D TSV
Set 243838/541.30 - 1000 nM1NL6-750 J Comb Chem 1999 1:207-15 J Med Chem 2001 44:1380-95 2D 3D TSV
Cathepsin S
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2443018/290.800 - 2900 nM3N3G-93N Bioorg Med Chem Lett 2010 20:4447-50 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:4507-10 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:4350-4 US9115126 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:932-5 2D 3D TSV
Set 2452431/331.00 - 12000 nM2F1G-GNF Bioorg Med Chem Lett 2006 16:1975-80 2D 3D TSV
Set 2467019/310.500 - 340000 nM1MS6-BLN 2R9M-Y11 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:2465-9 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:2549-54 J Med Chem 2010 53:4545-9 J Med Chem 2010 53:7902-17 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:7189-93 J Enzyme Inhib Med Chem 2014 29:538-46 J Med Chem 2002 45:5471-82 US8609681 2D 3D TSV
Set 2471015/1811.0 - 10000 nM3OVX-O64 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:6890-4 2D 3D TSV
Cdc7 Kinase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2489210/162.00 - 5000 nM4F9B-0SY J Med Chem 2008 51:487-501 US9670191 J Med Chem 2009 52:293-307 2D 3D TSV
CDK2/CycE
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2492219/282.00 - 1000 nM1R78-FMD Bioorg Med Chem Lett 2004 14:913-7 2D 3D TSV
Set 2502619/233.00 - 5500 nM1P2A-5BN Bioorg Med Chem Lett 2003 13:2465-8 2D 3D TSV
Set 251918/262.00 - 5600 nM3NS9-NS9 J Med Chem 2009 52:655-63 Eur J Med Chem 2016 110:291-301 J Med Chem 2008 51:4986-99 US8580782 Nat Rev Drug Discov 2017 16:424-440 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:863-7 2D 3D TSV
Set 2521317/2512.0 - 750 nM2VU3-LZE J Med Chem 2016 59:8667-8684 Nat Biotechnol 2011 29:1046-51 J Med Chem 2008 51:4986-99 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:3420-35 2D 3D TSV
Set 2534918/3133.0 - 100000 nM1H00-FAP 1H07-MFP 1H08-BWP 1V1K-3FP Bioorg Med Chem Lett 2003 13:2961-6 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:2955-60 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:3021-6 J Med Chem 2005 48:3313-8 J Med Chem 2006 49:5470-7 Eur J Med Chem 2016 108:701-19 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:2394-9 US8507510 2D 3D TSV
Set 25411623/331.00 - 100000 nM2WIH-P48 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:4095-9 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:6489-94 J Med Chem 2013 56:10045-65 J Med Chem 2010 53:3532-51 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:2969-74 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:4507-11 J Med Chem 2009 52:5152-63 2D 3D TSV
Set 2553919/317.00 - 3700 nM2B55-D31 J Med Chem 2002 45:5224-32 J Med Chem 2002 45:5233-48 2D 3D TSV
Set 2567919/292.00 - 260 nM2B52-D42 J Med Chem 2016 59:8667-8684 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:5489-91 J Med Chem 2002 45:5224-32 J Med Chem 2002 45:5233-48 AAPS J 2006 8:204-21 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:343-6 Eur J Med Chem 2016 108:701-19 2D 3D TSV
Set 2576717/281.00 - 25000 nM4LYN-1YG J Med Chem 2006 49:3766-9 J Med Chem 2004 47:1719-28 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:6236-9 Bioorg Med Chem Lett 2009 18:5763-5 J Med Chem 2002 45:3905-27 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:5521-5 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:2973-7 J Med Chem 2014 57:578-99 2D 3D TSV
Set 25817320/320.050 - 250000 nM1G5S-I17 3DDP-RC8 J Med Chem 2016 59:8667-8684 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:6608-12 J Med Chem 2000 43:2506-13 J Med Chem 2008 51:2589-99 AAPS J 2006 8:204-21 J Med Chem 2001 44:524-30 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:6613-7 US8846696 J Biol Chem 2005 280:31220-9 Eur J Med Chem 2016 110:291-301 US8592581 Proc Natl Acad Sci USA 2007 104:20523-8 J Med Chem 2014 57:578-99 Eur J Med Chem 2016 108:701-19 Science 1998 281:533-538 J Med Chem 2010 53:2681-94 2D 3D TSV
Set 2597218/304.00 - 100000 nM2B54-D05 Chem Biol 2006 13:711-22 J Med Chem 2004 47:5894-911 Bioorg Med Chem Lett 2016 26:3093-7 Chem Biol 2005 12:1103-15 2D 3D TSV
Set 2601425/30250 - 20000 nM1YKR-628 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:1943-7 2D 3D TSV
Set 2612926/2826.0 - 2500 nM1PYE-PM1 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:6095-9 2D 3D TSV
Set 2623516/25550 - 250000 nM2B53-D23 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:1157-60 AAPS J 2006 8:204-21 2D 3D TSV
Set 2631319/2110.0 - 7500 nM2BHE-BRY Chembiochem 2005 6:531-40 Eur J Med Chem 2016 108:415-22 J Med Chem 2017 60:4949-4962 2D 3D TSV
Set 2642616/203.00 - 100000 nM1OIQ-HDU Bioorg Med Chem Lett 2011 21:4698-701 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:3021-6 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:5487-92 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:2245-8 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:3463-7 AAPS J 2006 8:204-21 Eur J Med Chem 2016 108:701-19 2D 3D TSV
Set 2653422/311.00 - 10000 nM1URW-I1P Bioorg Med Chem Lett 2011 21:4698-701 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:3021-6 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:5487-92 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:2245-8 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:2249-52 2D 3D TSV
Set 26612513/220.200 - 100000 nM1PXJ-CK2 1PXM-CK5 1PXN-CK6 2C5O-CK2 Chem Biol 2010 17:1111-21 J Med Chem 2004 47:1662-75 Chem Biol 2006 13:201-11 J Med Chem 2010 53:4367-78 Eur J Med Chem 2016 108:701-19 J Med Chem 2016 59:8667-8684 J Med Chem 2013 56:660-70 J Med Chem 2013 56:640-59 Eur J Med Chem 2013 70:447-55 2D 3D TSV
CDK2/Cyclin A/Cyclin A1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 267714/15550 - 100000 nM2CLX-F18 J Med Chem 2006 49:6500-9 Chem Biol Drug Des 2014 84:402-8 2D 3D TSV
Set 2682214/263.00 - 97000 nM2VTN-LZ7 2VTP-LZ9 2VTQ-LZA J Med Chem 2008 51:4986-99 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:3420-35 J Med Chem 2016 59:8667-8684 Nat Biotechnol 2011 29:1046-51 2D 3D TSV
Set 26910519/300.110 - 100000 nM4BCK-T3E 4BCP-T3C J Med Chem 2013 56:660-70 Chem Biol 2010 17:1111-21 J Med Chem 2013 56:640-59 J Med Chem 2004 47:1662-75 Eur J Med Chem 2016 108:701-19 Eur J Med Chem 2013 70:447-55 J Med Chem 2010 53:4367-78 J Med Chem 2016 59:8667-8684 2D 3D TSV
CDK2/Cyclin E/G1/S-specific cyclin E2
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 27016314/220.070 - 250000 nM1W0X-OLO J Med Chem 2016 59:8667-8684 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:6608-12 J Med Chem 2000 43:2506-13 J Med Chem 2008 51:2589-99 AAPS J 2006 8:204-21 J Med Chem 2001 44:524-30 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:6613-7 J Med Chem 2010 53:2681-94 US8846696 J Biol Chem 2005 280:31220-9 Eur J Med Chem 2016 110:291-301 US8592581 Proc Natl Acad Sci USA 2007 104:20523-8 J Med Chem 2014 57:578-99 Eur J Med Chem 2016 108:701-19 2D 3D TSV
CDK6/G1/S-specific cyclin D3
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 271529/3526.0 - 1100 nM4EZ5-0RS ACS Med Chem Lett 2012 3:445-449 2D 3D TSV
Cellular retinoic acid-binding protein I
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2721415/220.300 - 10000 nM1CBR-REA J Med Chem 1995 38:2302-10 J Med Chem 1996 39:3625-35 2D 3D TSV
cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 27315122/310.050 - 10000 nM3SHY-5FO 3SHZ-5CO 3SIE-5BO 4G2W-NI0 4G2Y-NI5 4OEW-5IO 4OEX-5EO Bioorg Med Chem Lett 2002 12:865-8 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:3900-7 J Med Chem 2014 57:3588-93 J Med Chem 2018 61:1001-1018 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:4271-4 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:2790-4 J Med Chem 2001 43:5037-43 Eur J Med Chem 2013 60:285-94 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:2099-103 J Med Chem 2017 60:6622-6637 J Med Chem 2000 43:2523-9 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:2461-4 J Med Chem 2008 51:2807-15 Bioorg Med Chem 2015 23:2121-8 J Med Chem 2016 59:8967-9004 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:2587-90 J Med Chem 2001 43:1257-63 J Med Chem 2012 55:10540-50 Bioorg Med Chem 2008 16:7599-606 2D 3D TSV
Set 27410822/310.220 - 88000 nM1UDU-CIA J Med Chem 2003 46:441-4 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:1425-8 J Med Chem 2002 45:4094-6 J Med Chem 2011 54:495-509 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:761-5 J Med Chem 2004 47:656-62 Eur J Med Chem 2010 45:1278-86 2D 3D TSV
Choline kinase alpha
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2751315/3266.0 - 5000 nM5EQE-5R8 5EQY-5RA J Med Chem 2016 59:671-86 2D 3D TSV
Cholinesterases
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2762517/1916.0 - 100000 nM4EY5-HUP J Nat Prod 2012 75:1400-4 J Nat Prod 2014 77:2054-9 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:2565-8 Bioorg Chem 2016 68:112-123 Bioorg Med Chem 2009 17:6937-41 2D 3D TSV
Set 2771621/341.00 - 23000 nM4TPK-3F9 J Med Chem 2014 57:8167-79 J Med Chem 2018 61:119-139 Bioorg Med Chem 2017 25:633-645 2D 3D TSV
Set 2782329/381.00 - 100000 nM4M0F-1YK 28850227Bioorg Med Chem Lett 2015 25:4848-53 Bioorg Med Chem Lett 2004 15:353-6 Bioorg Med Chem Lett 2000 10:1315-6 2D 3D TSV
Clathrin heavy chain 1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2791520/276900 - 120000 nM2XZG-VH1 J Med Chem 2014 57:131-43 2D 3D TSV
Coagulation factor III/Factor VIIa (fVIIa)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2802929/420.350 - 8100 nM4JYU-1OK 4JYV-1OJ Bioorg Med Chem Lett 2013 23:5244-8 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:2169-73 2D 3D TSV
Set 2819429/490.240 - 54000 nM4X8V-3Z9 4ZXX-4T0 4ZXY-4T1 ACS Med Chem Lett 2017 8:67-72 J Med Chem 2016 59:7125-37 J Med Chem 2015 58:6225-36 ACS Med Chem Lett 2016 7:1077-1081 Bioorg Med Chem Lett 2017 27:2650-2654 Bioorg Med Chem Lett 2016 26:5051-5057 US9174974 J Med Chem 2016 59:4007-18 2D 3D TSV
Set 2826328/398.00 - 2400 nM2AEI-03R Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4752-6 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:1060-4 2D 3D TSV
Coagulation factor VII
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2831221/411.30 - 350 nM1W2K-380 1W7X-413 1W8B-413 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:5344-52 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:5244-8 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:2169-73 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:817-22 2D 3D TSV
Set 2842422/3228.0 - 750 nM2BZ6-346 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:5344-52 Bioorg Med Chem 2006 14:5357-69 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:2169-73 2D 3D TSV
Set 2853930/407.00 - 190000 nM4JZE-1NK 4JZF-1NL Bioorg Med Chem Lett 2013 23:5239-43 Bioorg Med Chem 2009 17:3934-58 Bioorg Med Chem 2006 15:160-73 2D 3D TSV
Set 2862225/291.00 - 39000 nM2F9B-N1H Bioorg Med Chem Lett 2001 11:2253-6 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:1596-600 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:2243-6 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:2270-3 2D 3D TSV
Set 2877425/360.078 - 16000 nM2B7D-C1B Bioorg Med Chem Lett 2001 11:2253-6 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:1596-600 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:2224-8 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:2243-6 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:2037-41 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:2270-3 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:4567-70 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:3829-32 2D 3D TSV
Set 2886021/271.30 - 130000 nM2FLR-7NH Bioorg Med Chem Lett 2001 11:2253-6 J Med Chem 2001 44:3856-71 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:2270-3 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:4567-70 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:3197-200 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:3829-32 2D 3D TSV
Set 2899830/431.70 - 30000 nM1Z6J-PY3 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:3006-11 J Med Chem 2003 46:4050-62 J Med Chem 2008 51:282-97 J Med Chem 2015 58:8315-59 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:4568-74 J Med Chem 2003 46:4696-701 2D 3D TSV
Set 2902929/321.30 - 8100 nM1YGC-905 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:5244-8 2D 3D TSV
Set 2912125/391.70 - 1800 nM4YT6-4JY 4YT7-4K1 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:2169-73 2D 3D TSV
Set 292726/380.620 - 8800 nM4ISH-1GE Bioorg Med Chem Lett 2013 23:2432-5 J Med Chem 2014 57:9915-32 2D 3D TSV
Coagulation factor X
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 2935625/350.070 - 3000 nM2BOH-IIA 2BQ6-IIB Bioorg Med Chem Lett 2004 14:4197-201 J Med Chem 2005 48:4511-25 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:4191-5 J Med Chem 2010 53:6243-74 2D 3D TSV
Set 29410520/371.00 - 17000 nM1LPG-IMA 1LPZ-CMB 1LQD-CMI 2BQ7-IID 2BQW-IIE Bioorg Med Chem Lett 2001 11:227-30 J Med Chem 2002 45:2749-69 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:4191-5 Bioorg Med Chem Lett 2000 10:957-61 J Med Chem 2005 48:4511-25 J Med Chem 2010 53:6243-74 2D 3D TSV
Set 29527419/380.510 - 39000 nM1F0R-815 1F0S-PR2 1NFX-RDR 1NFY-RTR 2J34-GS6 2J38-GS5 2J4I-GSJ 2J95-GSX J Med Chem 2003 46:681-4 J Med Chem 2010 53:6243-74 Bioorg Med Chem Lett 1999 9:2753-8 J Med Chem 2007 50:1546-57 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:23-7 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:2073-8 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:919-22 Bioorg Med Chem Lett 2000 10:1737-9 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:618-22 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:7516-21 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:723-8 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:5953-7 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:3784-8 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:28-33 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:5952-8 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:743-8 J Med Chem 1996 39:4531-6 J Med Chem 1999 42:3557-71 J Med Chem 1999 42:3572-87 2D 3D TSV
Set 29615620/331.00 - 39000 nM2CJI-GSK 2J2U-GSQ 4Y79-4O6 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:5953-7 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:3784-8 J Med Chem 2010 53:6243-74 J Med Chem 1996 39:4531-6 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:7516-21 J Med Chem 1999 42:3557-71 J Med Chem 2007 50:1546-57 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:2073-8 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:2927-30 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:645-8 2D 3D TSV
Set 29720919/350.020 - 22000 nM2UWL-895 2UWO-701 2UWP-894 2WYG-461 2WYJ-898 2Y81-931 2Y82-930 4Y6D-48U Bioorg Med Chem Lett 2010 20:618-22 J Med Chem 2010 53:6243-74 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:1588-92 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:2927-30 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:1582-7 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:7516-21 J Med Chem 2007 50:1546-57 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:5952-8 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:28-33 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:23-7 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:5953-7 J Med Chem 1999 42:3557-71 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:2428-33 2D 3D TSV
Set 29810521/350.020 - 1700 nM2Y7X-MZA 2Y7Z-C0Z 2Y80-439 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:5953-7 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:618-22 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:28-33 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:23-7 J Med Chem 2010 53:6243-74 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:1588-92 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:1582-7 J Med Chem 1999 42:3557-71 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:2428-33 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:7516-21 J Med Chem 1999 42:3572-87 2D 3D TSV
Set 299833/3611.0 - 340 nM3SW2-FI1 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:5953-7 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:7516-21 2D 3D TSV
Set 3009520/290.800 - 2800 nM1NFU-RRP Bioorg Med Chem Lett 2010 20:618-22 J Med Chem 2003 46:681-4 J Med Chem 2010 53:6243-74 Bioorg Med Chem Lett 1999 9:2753-8 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:2073-8 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:7516-21 J Med Chem 2007 50:1546-57 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:919-22 Bioorg Med Chem Lett 2000 10:1737-9 2D 3D TSV
Set 301520/2848.0 - 1200 nM1NFW-RRR J Med Chem 2003 46:681-4 2D 3D TSV
Set 3026226/360.400 - 4400 nM1EZQ-RPR J Med Chem 2000 43:305-41 Bioorg Med Chem Lett 2000 10:217-21 J Med Chem 2013 56:2016-28 J Med Chem 2010 53:6243-74 J Med Chem 1998 41:437-50 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:1671-4 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:1667-70 2D 3D TSV
Set 30340523/440.005 - 30000 nM1Z6E-IK8 2FZZ-5QC 2G00-4QC 3CS7-LG0 3FFG-FFG 3KQB-LGJ 3KQC-LGK 3KQD-LGL 3KQE-LGM 3M36-M35 3M37-M37 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:5584-9 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:1373-7 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:5263-7 J Med Chem 2001 44:566-78 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:1221-7 J Med Chem 2003 46:4405-18 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:4141-7 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:1229-34 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:1795-8 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:6481-8 J Med Chem 2010 53:6243-74 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:369-73 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:1651-5 J Med Chem 2005 48:1729-44 J Med Chem 2003 46:5298-315 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:5176-82 J Med Chem 2007 50:5339-56 J Med Chem 2011 54:2944-51 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:4118-23 Bioorg Med Chem Lett 2008 19:462-8 Bioorg Med Chem 2016 24:5646-5661 Bioorg Med Chem 2017 25:2800-2810 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:3341-5 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:3755-60 2D 3D TSV
Set 30411022/3510.0 - 10000 nM2BMG-I1H J Med Chem 2011 54:2944-51 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:2801-5 J Med Chem 2005 48:3290-312 2D 3D TSV
Set 30515523/360.004 - 5000 nM1MQ5-XLC 1MQ6-XLD 2P3T-993 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:507-11 J Med Chem 2010 53:6243-74 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:2179-85 J Med Chem 2007 50:2967-80 Bioorg Med Chem 2007 15:2127-46 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:2845-9 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:989-93 2D 3D TSV
Set 3064325/380.100 - 55000 nM1FJS-Z34 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4752-6 J Med Chem 2002 45:2484-93 J Med Chem 2010 53:6243-74 Biochemistry 2000 39:12534-42 J Med Chem 2003 46:5691-9 Bioorg Med Chem Lett 1999 8:2235-40 J Med Chem 1998 41:3557-62 2D 3D TSV
Set 3078129/392.00 - 34000 nM3HPT-YET 3K9X-MBM Bioorg Med Chem Lett 2009 19:4034-41 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:6882-9 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:7516-21 J Med Chem 2008 51:7541-51 J Med Chem 2011 54:2529-91 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:5453-8 J Med Chem 2010 53:6243-74 2D 3D TSV
Set 30810521/400.430 - 10000 nM2EI6-D92 2EI7-D93 2EI8-DT8 3IIT-D14 Bioorg Med Chem 2009 17:8206-20 Bioorg Med Chem 2011 19:1623-42 Bioorg Med Chem 2009 17:1193-206 J Med Chem 2010 53:6243-74 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:4587-92 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:2133-40 Bioorg Med Chem 2009 17:8221-33 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:782-7 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:4683-8 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:2935-9 2D 3D TSV
Set 3092123/357.80 - 10000 nM1V3X-D76 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:782-7 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:4683-8 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:2935-9 J Med Chem 2004 47:5167-82 2D 3D TSV
Set 3107420/320.270 - 12000 nM2P93-ME1 2P95-ME5 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:5041-8 J Med Chem 2010 53:6243-74 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:4419-27 2D 3D TSV
Set 3115426/370.210 - 7400 nM2P94-ME4 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:5041-8 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:4419-27 2D 3D TSV
Set 3125227/393.70 - 17000 nM2XBW-455 2XBX-RR8 2XC0-8NC 2XC4-IVK 2XC5-OYJ Bioorg Med Chem Lett 2010 20:5313-9 2D 3D TSV
Set 3136819/320.380 - 10000 nM3Q3K-D90 3TK6-D46 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:2133-40 Bioorg Med Chem 2011 19:1623-42 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:7337-43 2D 3D TSV
Set 3142822/360.380 - 690 nM3TK5-D1Q Bioorg Med Chem Lett 2011 21:7337-43 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:2133-40 2D 3D TSV
Set 3151829/380.200 - 3.40 nM4BTI-7R9 4BTU-6XS J Med Chem 2014 56:9441-56 2D 3D TSV
Set 316829/421.10 - 3.40 nM4BTT-VYR J Med Chem 2014 56:9441-56 2D 3D TSV
Set 31717618/300.700 - 130000 nM2W26-RIV Eur J Med Chem 2015 96:369-80 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:5817-22 J Med Chem 2010 53:6243-74 US8822458 Eur J Med Chem 2012 54:771-83 J Med Chem 2005 48:5900-8 US8487111 J Med Chem 2014 57:7770-91 Eur J Med Chem 2013 64:302-13 US10106557 2D 3D TSV
Set 3185624/400.020 - 4000 nM2PHB-230 2PR3-237 2W3I-L1C 2W3K-L1D J Med Chem 2010 53:6243-74 Bioorg Med Chem 2009 17:2501-11 Chem Biol Drug Des 2007 69:444-50 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:2428-33 2D 3D TSV
Coagulation factor XI
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 3193125/460.300 - 2400 nM4NA7-1T5 4NA8-1T6 J Med Chem 2014 57:955-69 2D 3D TSV
Collagenase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 3202020/320.200 - 17000 nM2PJT-347 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:3445-8 Bioorg Med Chem Lett 2006 17:34-9 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:4333-7 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:3927-31 J Med Chem 2005 48:6713-30 Bioorg Med Chem 2007 15:6170-81 2D 3D TSV
Set 321624/2872.0 - 6600 nM1XUC-PB3 1XUD-PB4 1XUR-PB5 Bioorg Med Chem Lett 2008 19:47-50 US9505743 Bioorg Med Chem 2009 17:990-1005 2D 3D TSV
Set 3224824/360.400 - 220 nM1ZTQ-033 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:4546-50 Eur J Med Chem 2013 60:89-100 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4961-6 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:6800-3 2D 3D TSV
Set 3236923/350.300 - 1100 nM3ELM-24F Bioorg Med Chem Lett 2002 12:2689-93 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:1975-9 J Med Chem 2009 52:3523-38 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:6485-90 Bioorg Med Chem 2007 15:2223-68 2D 3D TSV
Set 3245023/342.00 - 50000 nM3I7G-732 3I7I-518 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:5039-43 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:5321-4 2D 3D TSV
Set 3259720/330.002 - 10000 nM3WV1-WHH 3WV2-WGG 3WV3-WLL J Med Chem 2014 57:8886-902 J Med Chem 2017 60:608-626 Bioorg Med Chem 2016 24:6149-6165 Bioorg Med Chem 2014 22:5487-505 J Med Chem 2017 60:9585-9598 2D 3D TSV
Set 3264624/3410.0 - 10000 nM2YIG-5EL Bioorg Med Chem Lett 2011 22:271-7 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:4215-9 2D 3D TSV
Set 327526/380.200 - 2.00 nM3O2X-3O2 J Med Chem 2003 46:2376-96 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:2820-2 2D 3D TSV
Set 3285822/320.160 - 530 nM3KEC-3KE 3KEJ-3EJ Bioorg Med Chem Lett 2010 20:576-80 J Med Chem 2016 59:313-27 2D 3D TSV
Set 3292726/280.400 - 12.0 nM1YOU-PFD Bioorg Med Chem Lett 2005 15:1807-10 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:5822-6 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:6529-34 2D 3D TSV
Set 330922/3214.0 - 56000 nM5BPA-4UF J Med Chem 2011 54:8174-87 2D 3D TSV
Set 3311214/182400 - 500000 nM5BOT-4UM 5BOY-4UE J Med Chem 2011 54:8174-87 2D 3D TSV
Set 3329817/280.050 - 3900 nM3ZXH-E41 Eur J Med Chem 2010 45:5919-25 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:6440-5 J Med Chem 2006 49:51-69 Eur J Med Chem 2013 62:379-94 J Med Chem 2000 43:369-80 J Med Chem 2008 51:7968-79 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:3243-6 J Med Chem 2001 43:4948-63 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:3389-95 J Med Chem 1999 42:4547-62 J Med Chem 2001 44:3066-73 J Med Chem 2001 44:3074-82 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:1641-5 J Med Chem 2012 55:4714-27 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:2799-803 J Med Chem 2011 54:8289-98 J Med Chem 2000 42:5426-36 Bioorg Med Chem 2017 25:523-527 Eur J Med Chem 2013 60:89-100 Bioorg Med Chem 2007 15:2223-68 Bioorg Med Chem Lett 1999 9:1691-6 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4345-9 J Med Chem 2007 50:5752-64 J Med Chem 2000 43:156-66 J Med Chem 2009 52:4757-73 2D 3D TSV
Set 3336320/3310.2 - 10000 nM3TVC-E3P J Biol Chem 2012 287:26647-56 US8691753 2D 3D TSV
CREB-binding protein
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 3344224/3421.0 - 11000 nM4NR7-2LO 5CGP-53W Chem Biol 2015 22:1588-96 J Med Chem 2016 59:1249-70 J Med Chem 2017 60:5349-5363 2D 3D TSV
Set 3352020/3040.0 - 10000 nM5I89-69B 5I8G-69E ACS Med Chem Lett 2016 7:531-6 US10206931 J Med Chem 2017 60:10151-10171 2D 3D TSV
Set 3361912/14160 - 2000000 nM4YK0-98 ACS Med Chem Lett 2016 7:531-6 US10206931 2D 3D TSV
Set 3376019/22100 - 5000 nM5I8B-69F ACS Med Chem Lett 2016 7:531-6 US10206931 2D 3D TSV
Set 3383915/2493.0 - 20000 nM5I86-69A ACS Med Chem Lett 2016 7:531-6 US10206931 2D 3D TSV
Set 3391515/241000 - 64000 nM4TQN-UL4 J Med Chem 2016 59:1350-6 2D 3D TSV
Set 340619/196600 - 17000 nM4TS8-XZ8 J Med Chem 2016 59:3087-97 2D 3D TSV
Set 3411815/19770 - 87000 nM3SVH-KRG J Med Chem 2011 54:6761-70 J Med Chem 2013 56:3217-27 2D 3D TSV
Cruzipain
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 3422022/23210 - 65000 nM3KKU-B95 J Med Chem 2014 57:2380-92 2D 3D TSV
Set 343520/2213.0 - 40.0 nM3I06-QL2 J Med Chem 2010 53:52-60 2D 3D TSV
Cyclin-dependent kinase 2
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 3442922/283.00 - 300000 nM3WBL-PDY J Med Chem 2012 55:6700-15 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:863-7 2D 3D TSV
Set 3453517/243.00 - 26000 nM2R3R-6SC Bioorg Med Chem Lett 2010 21:467-70 Eur J Med Chem 2017 126:1118-1128 US8580782 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:1353-7 2D 3D TSV
Set 3461923/302.00 - 10000 nM2FVD-LIA J Med Chem 2006 49:6549-60 2D 3D TSV
Set 3471418/2110000 - 250000 nM1DI8-DTQ Bioorg Med Chem Lett 2017 27:2663-2667 J Med Chem 2000 43:133-8 Bioorg Med Chem 2014 22:6256-69 Nat Biotechnol 2008 26:127-32 2D 3D TSV
Set 348823/275.00 - 2200 nM4RJ3-3QS J Med Chem 2014 57:10176-91 2D 3D TSV
Set 3491421/2775.0 - 4400 nM2DUV-371 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:1284-7 2D 3D TSV
Set 3502722/317.00 - 100000 nM2R64-740 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:2292-5 2D 3D TSV
Set 3512419/2615.0 - 10000 nM3S2P-PMU Bioorg Med Chem Lett 2011 21:4203-5 2D 3D TSV
Set 3522528/3710000 - 40000 nM4NJ3-2KD Bioorg Med Chem Lett 2013 24:199-203 2D 3D TSV
Set 3537415/255.00 - 100000 nM1H1Q-2A6 1OI9-N20 J Med Chem 2004 47:3710-22 J Med Chem 2017 60:1746-1767 J Med Chem 2000 43:2797-804 J Med Chem 2002 45:3381-93 J Med Chem 2006 49:5141-53 J Med Chem 2009 52:2854-62 J Med Chem 2006 49:5470-7 2D 3D TSV
Set 3542912/251.10 - 100000 nM1E1X-NW1 1OGU-ST8 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:217-22 J Med Chem 2000 43:2797-804 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:3079-82 J Med Chem 2006 49:5141-53 J Med Chem 2004 47:3710-22 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:6641-5 AAPS J 2006 8:204-21 2D 3D TSV
Set 3551621/22180 - 25000 nM1GIH-1PU J Med Chem 2001 44:4628-40 AAPS J 2006 8:204-21 J Med Chem 2014 57:578-99 Chem Biol 2004 11:525-34 2D 3D TSV
Set 3568511/232.00 - 100000 nM1VYW-292 1VYZ-N5B 4EK4-1CK 4EK5-03K 4FKI-09K J Med Chem 2005 48:2944-56 J Med Chem 2004 47:3367-80 Eur J Med Chem 2008 43:2807-18 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:3205-8 AAPS J 2006 8:204-21 2D 3D TSV
Set 357715/1739.0 - 5400 nM1PF8-SU9 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:913-7 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:1939-42 Bioorg Med Chem 2003 11:1873-81 2D 3D TSV
Set 3581120/2310.0 - 7500 nM1E9H-INR Chembiochem 2005 6:531-40 Eur J Med Chem 2016 108:415-22 J Med Chem 2017 60:4949-4962 2D 3D TSV
Set 3597819/280.100 - 250000 nM1CKP-PVB J Med Chem 2016 59:8667-8684 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:6608-12 J Med Chem 2000 43:2506-13 AAPS J 2006 8:204-21 J Med Chem 2001 44:524-30 Chem Biol Drug Des 2006 67:46-57 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:6613-7 J Med Chem 2010 53:2681-94 US8846696 J Biol Chem 2005 280:31220-9 Eur J Med Chem 2016 110:291-301 US8592581 J Med Chem 2014 57:578-99 Eur J Med Chem 2016 108:701-19 2D 3D TSV
Set 3604218/30200 - 100000 nM1H01-FAL Bioorg Med Chem Lett 2003 13:2961-6 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:2955-60 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:3021-6 J Med Chem 2006 49:5470-7 Eur J Med Chem 2016 108:701-19 2D 3D TSV
Set 3613022/233.00 - 100000 nM1OIR-HDY Bioorg Med Chem Lett 2011 21:4698-701 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:3021-6 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:5487-92 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:2245-8 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:2249-52 Eur J Med Chem 2016 108:701-19 2D 3D TSV
Set 3628520/340.300 - 10000 nM2VV9-IM9 2W05-FRT 2W17-I19 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:4698-701 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:6486-9 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:4442-6 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:5487-92 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:6369-73 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:3021-6 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:2245-8 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:2249-52 2D 3D TSV
Set 3636522/321.20 - 100000 nM4FKQ-42K 4FKU-60K 4FKV-61K 4FKW-62K 4FX3-60K J Med Chem 2004 47:2534-49 J Med Chem 2008 51:1179-88 AAPS J 2006 8:204-21 J Med Chem 2001 44:4339-58 Eur J Med Chem 2016 122:366-381 2D 3D TSV
Set 3643518/251.90 - 100000 nM1KE9-LS5 4FKP-LS5 2D 3D TSV
Set 36512414/230.200 - 100000 nM1PXO-CK7 1PXP-CK8 2C5N-CK8 2WEV-CK7 3SW4-18K 3SW7-19K 4EK8-16K 4FKO-20K J Med Chem 2016 59:8667-8684 J Med Chem 2013 56:660-70 Chem Biol 2010 17:1111-21 J Med Chem 2013 56:640-59 J Med Chem 2004 47:1662-75 Chem Biol 2006 13:201-11 J Med Chem 2010 53:4367-78 Eur J Med Chem 2016 108:701-19 Eur J Med Chem 2013 70:447-55 2D 3D TSV
Set 3665416/180.300 - 25000 nM3EJ1-5BP Bioorg Med Chem Lett 2009 18:5758-62 J Med Chem 2004 47:4716-30 2D 3D TSV
Set 3673222/262.00 - 20000 nM3EID-PO5 Bioorg Med Chem Lett 2009 18:5758-62 J Med Chem 2004 47:4716-30 2D 3D TSV
Set 3683618/270.200 - 5000 nM2XMY-CDK J Med Chem 2016 59:8667-8684 J Med Chem 2013 56:660-70 Chem Biol 2010 17:1111-21 J Med Chem 2013 56:640-59 Eur J Med Chem 2013 70:447-55 2D 3D TSV
Set 3692214/225.00 - 10000 nM3LFS-A07 Eur J Med Chem 2008 43:949-57 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:3059-62 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:1985-9 2D 3D TSV
Cyclin-Dependent Kinase 2 (CDK2)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 3704715/352.00 - 300000 nM1Y91-CT9 2C6K-DT2 2C6L-DT4 2C6M-DT5 2C6T-DT5 2VTS-LZC J Med Chem 2012 55:6700-15 J Med Chem 2008 51:4986-99 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:1353-7 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:863-7 J Med Chem 2010 53:8508-22 Eur J Med Chem 2016 110:291-301 Nat Rev Drug Discov 2017 16:424-440 2D 3D TSV
Set 3711718/2310.0 - 13000 nM2C69-CT8 Eur J Med Chem 2017 126:1118-1128 US8580782 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:1353-7 2D 3D TSV
Set 3722024/334.10 - 110000 nM3EZR-EZR Bioorg Med Chem Lett 2009 19:908-11 Bioorg Med Chem 2006 14:1792-804 2D 3D TSV
Set 3731218/2430.0 - 150000 nM2UZB-C75 2UZD-C85 2UZE-C95 2UZL-C94 2UZN-C96 2UZO-C62 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:3880-5 2D 3D TSV
Set 374614/14730 - 85000 nM2VTL-LZ5 J Med Chem 2008 51:4986-99 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:3420-35 2D 3D TSV
Set 3752116/263.00 - 85000 nM2VTO-LZ8 2VTT-LZD J Med Chem 2016 59:8667-8684 Nat Biotechnol 2011 29:1046-51 J Med Chem 2008 51:4986-99 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:3420-35 2D 3D TSV
Set 3761129/401.70 - 10000 nM1PKD-UCN Bioorg Med Chem Lett 2003 13:3835-9 J Biol Chem 2002 277:46609-15 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:3841-6 Nat Biotechnol 2011 29:1046-51 Blood 2009 114:2984-92 US10189849 PubChem BioAssay aid1433 J Med Chem 2013 56:3768-82 Nat Biotechnol 2008 26:127-32 2D 3D TSV
Set 377617/23140 - 1800 nM2W1H-L0F J Med Chem 2009 52:379-88 2D 3D TSV
Set 3787115/275.00 - 100000 nM1H1R-6CP 1OIU-N76 1OIY-N41 J Med Chem 2004 47:3710-22 J Med Chem 2017 60:1746-1767 J Med Chem 2000 43:2797-804 J Med Chem 2002 45:3381-93 J Med Chem 2006 49:5141-53 J Med Chem 2009 52:2854-62 J Med Chem 2006 49:5470-7 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:3079-82 2D 3D TSV
Set 3791217/275.00 - 7400 nM2C6I-DT1 J Med Chem 2017 60:1746-1767 J Med Chem 2006 49:5470-7 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:1353-7 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:863-7 2D 3D TSV
Set 3806616/251.00 - 25000 nM5D1J-56H J Med Chem 2006 49:3766-9 J Med Chem 2004 47:1719-28 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:6236-9 Bioorg Med Chem Lett 2009 18:5763-5 J Med Chem 2002 45:3905-27 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:2973-7 2D 3D TSV
Set 38117617/270.050 - 250000 nM2A4L-RRC 3DDQ-RRC J Med Chem 2016 59:8667-8684 Science 1998 281:533-538 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:6608-12 J Med Chem 2013 56:660-70 J Med Chem 2000 43:2506-13 J Med Chem 2008 51:2589-99 AAPS J 2006 8:204-21 J Med Chem 2001 44:524-30 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:6613-7 J Med Chem 2010 53:2681-94 US8846696 J Biol Chem 2005 280:31220-9 Eur J Med Chem 2016 110:291-301 US8592581 Proc Natl Acad Sci USA 2007 104:20523-8 J Med Chem 2014 57:578-99 Eur J Med Chem 2016 108:701-19 2D 3D TSV
Set 3824318/232.00 - 100000 nM4EK6-10K J Med Chem 2005 48:2944-56 J Med Chem 2004 47:3367-80 AAPS J 2006 8:204-21 Eur J Med Chem 2008 43:2807-18 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:3205-8 2D 3D TSV
Set 3833818/260.540 - 10000 nM1KE5-LS1 1KE8-LS4 Chembiochem 2005 6:531-40 J Med Chem 2004 47:2534-49 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:953-7 J Med Chem 2008 51:1179-88 J Med Chem 2001 44:4339-58 J Med Chem 2005 48:3313-8 2D 3D TSV
Set 3848717/200.520 - 100000 nM2C5V-CK4 1PXL-CK4 J Med Chem 2016 59:8667-8684 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:6231-5 J Med Chem 2013 56:660-70 Chem Biol 2010 17:1111-21 J Med Chem 2013 56:640-59 J Med Chem 2004 47:1662-75 J Med Chem 2010 53:4367-78 Eur J Med Chem 2016 108:701-19 Eur J Med Chem 2013 70:447-55 2D 3D TSV
Cyclin-Dependent Kinase 5 (CDK5)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 3851818/18330 - 10000 nM4AU8-Z3R Bioorg Med Chem Lett 2012 22:5919-23 2D 3D TSV
Cyclin-dependent kinase 6
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 38626921/330.360 - 10000 nM2EUF-LQQ 4TTH-24V US8841312 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:3420-35 J Med Chem 2014 57:578-99 Eur J Med Chem 2016 122:546-556 US9464092 2D 3D TSV
Cyclin-Dependent Kinase 6 (CDK6)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 387618/211700 - 300000 nM1XO2-FSE J Med Chem 2005 48:737-43 2D 3D TSV
Cyclin-dependent kinase 8
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 3883523/301.60 - 700 nM5BNJ-4TV 5HBJ-5Y8 J Med Chem 2016 59:1078-101 2D 3D TSV
Set 3892521/311.90 - 700 nM5HBE-5Y6 5HBH-5Y7 J Med Chem 2016 59:1078-101 2D 3D TSV
Cyclin-dependent kinase 9
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 390814/16280 - 26000 nM3TN8-F18 3TNH-F18 J Med Chem 2006 49:6500-9 Chem Biol Drug Des 2014 84:402-8 J Med Chem 2013 56:660-70 Eur J Med Chem 2011 46:4289-94 2D 3D TSV
Cyclin-Dependent Kinase 9 (CDK9)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 3911323/292.10 - 300 nM3BLR-CPB J Med Chem 2016 59:8667-8684 Bioorg Med Chem Lett 2016 26:3457-63 PubChem BioAssay aid1433 2D 3D TSV
Cytochrome P450 17A1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 3923018/301.00 - 4000 nM3RUK-AER ACS Med Chem Lett 2016 7:40-5 J Med Chem 2013 56:4880-98 J Med Chem 1999 41:5375-81 J Med Chem 1995 38:2463-71 US9611270 J Med Chem 2000 43:4266-77 J Med Chem 2005 48:2972-84 J Med Chem 1997 40:3297-304 2D 3D TSV
Set 3931624/337.00 - 260000 nM3SWZ-TOK J Med Chem 2013 56:4880-98 J Med Chem 2015 58:2077-87 J Med Chem 2003 46:2345-51 J Med Chem 2005 48:2972-84 2D 3D TSV
Cytochrome P450 19A1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 39414118/251.40 - 1200000 nM3S7S-EXM J Med Chem 1996 39:2245-52 Eur J Med Chem 2009 44:4121-7 J Med Chem 2012 55:8464-76 J Med Chem 1989 32:651-8 J Med Chem 2001 44:4277-83 Eur J Med Chem 2015 102:375-86 J Med Chem 1996 39:757-72 J Med Chem 2012 55:3992-4002 J Med Chem 1991 34:1748-50 J Med Chem 1994 37:2198-205 J Med Chem 1994 37:1312-9 J Med Chem 1997 40:3263-70 Bioorg Med Chem 2016 24:2823-31 J Med Chem 1996 39:1033-8 Eur J Med Chem 2014 87:336-45 Eur J Med Chem 2015 105:1-38 J Med Chem 2016 59:5131-48 J Med Chem 1990 33:2933-42 2D 3D TSV
Cytochrome P450 1A
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 3955016/211.80 - 4000 nM4I8V-BHF Bioorg Med Chem 2010 18:6310-5 J Med Chem 2015 58:3534-47 Bioorg Med Chem 2007 15:5047-60 28458135J Med Chem 2015 58:6481-93 Bioorg Med Chem 2011 19:2842-9 Eur J Med Chem 2017 130:320-327 J Med Chem 2013 56:4082-92 2D 3D TSV
Set 3964516/2114.0 - 20000 nM2HI4-BHF Bioorg Med Chem 2010 18:6310-5 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:6008-12 J Med Chem 2015 58:3534-47 Bioorg Med Chem 2007 15:5047-60 J Med Chem 2015 58:6481-93 J Med Chem 2013 56:4082-92 2D 3D TSV
Cytochrome P450 3A
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 3971240/662900 - 61000 nM2J0D-ERY US9138393 US9144538 J Med Chem 2003 46:3778-81 Curr Drug Metab 2005 6:413-54 J Med Chem 2012 55:6111-23 2D 3D TSV
Set 3983028/374.00 - 80000 nM2V0M-KKK 2V0M-KLN Bioorg Med Chem 2017 25:750-758 US9150527 Drug Metab Dispos 2012 40:426-35 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:3974-7 J Med Chem 2018 61:834-864 J Med Chem 2003 46:1716-25 J Med Chem 1992 35:2818-25 J Med Chem 2016 59:3635-49 Bioorg Med Chem Lett 2016 26:5825-5829 2D 3D TSV
Cytohesin-2
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 399617/19540000 - 5100000 nM4JMO-JAF 4JWL-HRC 4JXH-HRC 4L5M-HRC J Med Chem 2013 56:8497-511 2D 3D TSV
D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 400513/144200 - 510000 nM2Y4A-BH6 Bioorg Med Chem 2012 20:3915-24 ACS Med Chem Lett 2011 2:219-223 2D 3D TSV
D-amino-acid oxidase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 401810/1644.0 - 350 nM3W4J-2LD US9180122 US10202399 2D 3D TSV
Set 4021111/111400 - 6000 nM3CUK-4P5 J Med Chem 2013 56:3710-24 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:3386-91 2D 3D TSV
Set 4032411/123.00 - 26000 nM3G3E-G3E Eur J Med Chem 2011 46:4808-19 J Med Chem 2009 52:3576-85 2D 3D TSV
Death-associated protein kinase 1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 404633/381.40 - 10000 nM1WVY-STO Nat Biotechnol 2011 29:1046-51 Blood 2009 114:2984-92 PubChem BioAssay aid1433 Nat Biotechnol 2008 26:127-32 2D 3D TSV
Set 4051315/218900 - 300000 nM5AUU-LU2 5AUY-MRI J Med Chem 2015 58:7400-8 2D 3D TSV
Dehydrosqualene synthase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 406818/2240.0 - 300000 nM4F6V-ZYM ACS Med Chem Lett 2012 3:402-406 J Med Chem 2009 52:3869-80 2D 3D TSV
Deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase (dUTPase)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 4071324/34280 - 9400 nM3ARA-MKH J Med Chem 2012 55:2970-80 J Med Chem 2012 55:2960-9 US8530490 2D 3D TSV
Set 4082816/26130 - 20000 nM3ARN-MSJ US8883759 J Med Chem 2012 55:5483-96 J Med Chem 2012 55:2970-80 US8530490 2D 3D TSV
Dihydrofolate reductase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 4095721/420.000 - 50000 nM1OHJ-COP 1OHK-COP 1U72-MTX J Med Chem 1991 34:227-34 J Med Chem 1996 39:2536-40 J Med Chem 1991 34:203-8 Eur J Med Chem 2012 58:228-36 Bioorg Med Chem 2007 15:1266-74 J Med Chem 2004 47:6958-63 Bioorg Med Chem Lett 1999 9:1463-8 Eur J Med Chem 2013 64:401-9 J Med Chem 2002 45:1690-6 J Med Chem 1994 37:2167-74 J Med Chem 2017 60:1734-1745 J Med Chem 1991 34:1447-54 J Med Chem 1999 41:5310-9 J Med Chem 2012 55:8318-29 J Med Chem 1991 34:574-9 J Med Chem 1996 39:66-72 J Med Chem 1991 34:222-7 J Med Chem 1996 39:56-65 J Med Chem 1988 31:449-54 2D 3D TSV
Set 4104413/210.800 - 600000 nM1YHO-TOP J Med Chem 1995 38:967-72 Bioorg Med Chem 2009 17:4866-72 J Med Chem 1987 30:1998-2004 J Med Chem 1989 32:1936-42 J Med Chem 2004 47:2475-85 J Med Chem 1988 31:122-9 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:2428-33 J Med Chem 1999 42:4300-12 J Med Chem 1989 32:1949-58 J Med Chem 2004 47:1475-86 2D 3D TSV
Set 4116615/210.010 - 420000 nM2HM9-TOP 1LUD-TOP J Med Chem 1982 25:777-84 J Med Chem 1989 32:1895-905 J Med Chem 1985 27:1672-6 2D 3D TSV
Set 4128016/3145.0 - 7200 nM4KAK-06U 4KBN-25U 4KD7-9DR 4KEB-1QZ 4KFJ-1R0 J Med Chem 2014 57:2643-56 Bioorg Med Chem 2009 17:4866-72 US8853228 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:1279-84 J Med Chem 2008 51:7532-40 ACS Med Chem Lett 2016 7:692-6 2D 3D TSV
Set 413728/3321.0 - 79.0 nM3S7A-684 J Med Chem 2004 47:2475-85 2D 3D TSV
Set 4141130/3611.0 - 22000 nM3NTZ-3TZ 3NU0-3TU J Med Chem 1988 31:449-54 J Med Chem 1983 26:605-7 Bioorg Med Chem 2011 19:3585-94 2D 3D TSV
Set 415822/223900 - 52000 nM3K47-D09 Bioorg Med Chem 2009 17:7324-36 2D 3D TSV
Set 4161020/226400 - 110000 nM3GYF-51P J Med Chem 2010 53:1413-37 J Med Chem 2000 43:3125-33 Bioorg Med Chem 2009 17:7324-36 2D 3D TSV
Set 4177514/270.190 - 31000 nM1KMS-LIH 2W3B-VG9 4G95-OAG J Med Chem 2004 47:2475-85 J Med Chem 1991 34:1447-54 J Med Chem 2001 45:41-53 J Med Chem 1999 41:5310-9 Eur J Med Chem 2015 95:76-95 J Med Chem 1993 36:3437-43 J Med Chem 2002 45:5173-81 2D 3D TSV
Set 418530/332.70 - 20000 nM1HFR-COE J Med Chem 1994 37:1169-76 Bioorg Med Chem 2010 18:953-61 J Med Chem 1995 38:745-52 2D 3D TSV
Set 4193014/224.60 - 160000 nM4QHV-IXF 4QJC-IXE J Med Chem 1998 41:3426-34 J Med Chem 1996 39:1438-46 J Med Chem 2013 56:4422-41 2D 3D TSV
Dihydrofolate Reductase (DHFR)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 4203817/260.020 - 15.3 nM3SQY-Q11 3SR5-Q12 3SRQ-Q19 3SRR-Q20 3SRS-M23 3SRU-Q26 3SRW-Q27 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:5171-6 US8835445 2D 3D TSV
Set 4213122/300.002 - 4.20 nM4LAE-1VM 4LAG-1VN 4LAH-1VO 4LEK-1DN J Med Chem 2014 57:651-68 US8835445 2D 3D TSV
Set 4222720/330.000 - 21000 nM1KLK-PMD 3CD2-MTX J Med Chem 1996 39:1271-80 J Med Chem 1999 42:4853-60 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:4366-70 J Med Chem 2005 48:4420-31 J Med Chem 1998 41:1409-16 J Med Chem 1994 36:4161-71 J Med Chem 1996 38:4739-59 J Med Chem 1997 40:1173-7 2D 3D TSV
Set 4233915/310.097 - 63000 nM1DYR-TOP 2FZH-DH1 2FZI-DH3 3NZ6-D2J 3NZ9-D2K 3NZA-D2K 3NZB-D2N 3TD8-D2R J Med Chem 1995 38:967-72 J Med Chem 2003 46:1726-36 J Med Chem 1997 40:3694-9 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:1811-5 J Med Chem 1996 38:4739-59 J Med Chem 2005 48:4420-31 J Med Chem 2008 51:6195-200 2D 3D TSV
Set 424326/272.40 - 7.00 nM3FRF-I2H 3FYV-I2H 3FYW-I2H J Med Chem 2014 57:651-68 Antimicrob Agents Chemother 2010 54:3825-33 2D 3D TSV
Set 4252019/280.550 - 2700 nM3CSE-N22 3EEJ-53R 3EEK-53S 3EEL-53T 3EEM-52V 3QLX-QLR 3QLY-55V Chem Biol 2008 15:990-6 Chem Biol Drug Des 2009 73:62-74 2D 3D TSV
Set 4262419/23940 - 35000 nM2KGK-N22 J Med Chem 2010 53:7327-36 J Med Chem 2008 51:7532-40 2D 3D TSV
Set 4273318/282.40 - 410 nM3F0B-53R 3F0S-53T 3SH2-5DR 4XE6-06U 4XEC-06U Cell Chem Biol 2016 23:1458-1467 Drug Metab Dispos 2012 40:2002-8 US8853228 ACS Med Chem Lett 2016 7:692-6 Antimicrob Agents Chemother 2010 54:3825-33 2D 3D TSV
Set 4285215/252.50 - 120000 nM1LY3-COG 1LY4-COQ J Med Chem 1998 41:3426-34 J Med Chem 2001 44:2391-402 J Med Chem 1995 37:4522-8 J Med Chem 1995 38:745-52 J Med Chem 2008 51:6195-200 J Med Chem 2005 48:1448-69 J Med Chem 1996 39:1438-46 2D 3D TSV
Set 429820/3138.0 - 280000 nM1DAJ-COE J Med Chem 1998 41:1263-71 J Med Chem 1997 40:1173-7 J Med Chem 2005 48:1448-69 J Med Chem 1998 41:1409-16 2D 3D TSV
Set 4302222/30260 - 40000 nM1VJ3-TAB J Med Chem 1997 40:1886-93 2D 3D TSV
Dihydrofolate Reductase-Thymidylate Synthase (DHFR-TS) Mutant KICB1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 4313614/1714.0 - 60000 nM1J3J-CP6 J Med Chem 1998 41:1367-70 J Med Chem 2004 47:4258-67 J Med Chem 2004 47:673-80 2D 3D TSV
Dihydrofolate Reductase-Thymidylate Synthase (DHFR-TS) Mutant SP21
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 4321914/17300 - 50000 nM2BLA-CP6 2BLC-CP7 Antimicrob Agents Chemother 2006 50:3631-7 2D 3D TSV
Dihydrolipoyl dehydrogenase (Lpd)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 433916/2537.0 - 100000 nM4M52-M52 Biochemistry 2013 52:9375-84 2D 3D TSV
Dihydroorotate dehydrogenase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 4342315/2222.0 - 87000 nM3G0U-MDY 3G0X-MD7 Bioorg Med Chem Lett 2003 14:55-8 J Med Chem 2009 52:2683-93 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:7268-72 J Med Chem 2013 56:7911-24 2D 3D TSV
Set 435616/192700 - 50000 nM1D3H-A26 J Med Chem 2013 56:7911-24 2D 3D TSV
Set 43612319/281.00 - 310000 nM1D3G-BRE 4IGH-1EA J Med Chem 2007 50:21-39 ACS Med Chem Lett 2013 4:517-521 Bioorg Med Chem Lett 1999 8:307-12 Bioorg Med Chem Lett 1999 8:1745-50 2D 3D TSV
Set 4371422/271.00 - 1000 nM2FPY-ILF Bioorg Med Chem Lett 2006 16:267-70 2D 3D TSV
Set 4383823/304.00 - 8400 nM2FPT-ILB Bioorg Med Chem Lett 2003 14:55-8 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4854-7 2D 3D TSV
Set 439918/243700 - 100000 nM2B0M-201 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:1610-5 2D 3D TSV
Set 4406217/262700 - 200000 nM4OQV-2V6 J Med Chem 2009 52:1864-72 J Med Chem 2011 54:3935-49 J Med Chem 2011 54:5540-61 J Med Chem 2014 57:5381-94 2D 3D TSV
Set 4413916/2418.0 - 10000 nM4RLI-3SH J Med Chem 2012 55:8341-9 J Med Chem 2015 58:1123-39 2D 3D TSV
Set 4421315/20890 - 10000 nM4JGD-4JG J Med Chem 2012 55:8341-9 J Med Chem 2015 58:1123-39 2D 3D TSV
Dihydroorotate Dehydrogenase (DHODH)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 4431520/261.00 - 1000 nM2FPV-ILC J Med Chem 2006 49:1239-47 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:267-70 2D 3D TSV
Set 444721/26130 - 100000 nM4ORI-2V6 J Med Chem 2014 57:5381-94 2D 3D TSV
Dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 (DDAH)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 4452612/152000 - 5000000 nM2JAJ-D20 3I4A-LN5 Biochemistry 2009 48:8624-35 US8921421 J Enzyme Inhib Med Chem 2012 27:24-8 Bioorg Med Chem 2008 16:2305-12 2D 3D TSV
Set 446712/1358000 - 5000000 nM2JAI-CIR Biochemistry 2009 48:8624-35 J Enzyme Inhib Med Chem 2012 27:24-8 Bioorg Med Chem 2008 16:2305-12 2D 3D TSV
Dipeptidyl peptidase 2 (DPP II)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 447809/140.880 - 1000000 nM3N0T-OPY Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4256-60 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:1908-12 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:1265-8 J Med Chem 2005 48:1768-80 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:2825-8 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:687-91 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:4154-8 J Med Chem 2003 46:5005-14 J Med Chem 2004 47:2906-16 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:507-10 2D 3D TSV
Dipeptidyl peptidase 4
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 4481624/284.80 - 830 nM3F8S-PF2 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:1991-5 Chem Biol Drug Des 2013 82:156-66 2D 3D TSV
Set 44913415/252.40 - 1000000 nM3W2T-LF7 Bioorg Med Chem 2008 16:190-208 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:3412-7 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:3516-21 Chem Biol Drug Des 2014 84:364-77 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3596-600 Bioorg Med Chem 2007 15:2715-35 J Med Chem 2003 46:2774-89 Bioorg Med Chem 2007 15:2631-50 J Med Chem 2014 57:3053-74 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3565-8 J Med Chem 2005 48:1768-80 J Med Chem 2006 49:3068-76 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3521-5 J Med Chem 2006 49:6416-20 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:2441-5 Bioorg Med Chem 2008 16:4093-106 J Med Chem 2006 49:3520-35 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:6476-80 Bioorg Med Chem 2006 15:641-55 2D 3D TSV
Set 45022819/330.480 - 100000 nM2BUB-FPB 2OLE-KR2 3EIO-AJH J Med Chem 2008 51:589-602 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:4818-23 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:3809-12 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:5545-9 Bioorg Med Chem 2009 17:1783-802 J Med Chem 2011 54:5737-46 Bioorg Med Chem 2014 22:6684-93 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:5151-5 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:4763-6 Eur J Med Chem 2010 45:4953-62 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:2622-8 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:5435-8 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:1903-7 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:6525-9 J Med Chem 2008 51:3661-80 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:6340-5 Eur J Med Chem 2014 86:242-56 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:49-52 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:2404-7 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:3706-10 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:4201-3 Bioorg Med Chem Lett 2017 27:2313-2318 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:1366-70 Eur J Med Chem 2008 43:1889-902 2D 3D TSV
Set 4513617/270.100 - 170000 nM1RWQ-5AP Bioorg Med Chem Lett 2011 21:6630-5 Eur J Med Chem 2008 43:1603-11 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:1491-3 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:4759-62 2D 3D TSV
Set 4521089/131.10 - 1000000 nM1N1M-A3M Bioorg Med Chem 2008 16:1613-31 Bioorg Med Chem 2009 17:1783-802 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:2825-8 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:4154-8 J Med Chem 2003 46:2774-89 J Med Chem 2004 47:2906-16 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:859-63 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:1908-12 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:1731-4 J Med Chem 2006 49:6416-20 J Med Chem 2015 58:8315-59 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:687-91 J Med Chem 2003 46:5005-14 J Med Chem 2004 47:4135-41 Eur J Med Chem 2008 43:1603-11 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4770-3 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:6476-80 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:507-10 2D 3D TSV
Set 4535916/310.500 - 100000 nM3KWF-B1Q 3OC0-B2Q Bioorg Med Chem Lett 2009 19:1908-12 Bioorg Med Chem 2009 17:1783-802 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:687-91 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:3271-5 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:1106-8 Eur J Med Chem 2008 43:1603-11 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:2966-70 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:1109-13 Chem Biol Drug Des 2014 84:364-77 J Med Chem 2006 49:373-80 2D 3D TSV
Set 45413522/350.080 - 5400 nM2RGU-356 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:1872-5 US9556175 Bioorg Med Chem 2013 21:1749-55 Chem Biol Drug Des 2014 84:364-77 J Med Chem 2007 50:6450-3 US9255098 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:3158-62 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:1464-8 US10202383 Eur J Med Chem 2016 124:103-116 US8697868 ACS Med Chem Lett 2016 7:498-501 ACS Med Chem Lett 2013 4:768-72 2D 3D TSV
Set 4552320/25250 - 100000 nM3OPM-LUI Bioorg Med Chem 2011 19:4953-70 J Med Chem 2004 47:4135-41 Eur J Med Chem 2008 43:1603-11 2D 3D TSV
Set 456722/2539.0 - 21000 nM2OGZ-U1N Bioorg Med Chem Lett 2007 17:1765-8 Chem Biol Drug Des 2014 84:364-77 2D 3D TSV
Set 4575422/331.60 - 3000 nM2OAG-DLI 2OQV-MA9 2QJR-PZF Bioorg Med Chem Lett 2007 17:2005-12 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:2464-9 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:5638-42 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:1810-4 J Med Chem 2007 50:1983-7 Chem Biol Drug Des 2014 84:364-77 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:4579-83 2D 3D TSV
Set 4581420/303.80 - 590 nM2OQI-GGO Bioorg Med Chem Lett 2014 24:1918-22 J Med Chem 2007 50:1983-7 2D 3D TSV
Set 4594625/410.300 - 1700 nM3Q8W-AZV Bioorg Med Chem Lett 2011 21:3809-12 Bioorg Med Chem 2014 22:6684-93 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:5151-5 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:1366-70 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:2404-7 2D 3D TSV
Set 4607521/260.330 - 17000 nM3G0B-T22 3G0G-RUM J Med Chem 2007 50:2297-300 US8907086 J Med Chem 2011 54:510-24 J Med Chem 2017 60:6480-6515 Bioorg Med Chem 2013 21:1749-55 Bioorg Med Chem 2012 20:5864-83 Eur J Med Chem 2012 52:205-12 Eur J Med Chem 2010 46:71-6 2D 3D TSV
Set 4612225/310.510 - 13.5 nM3VJM-W61 Bioorg Med Chem 2012 20:5033-41 Bioorg Med Chem 2012 20:5705-19 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:2618-21 2D 3D TSV
Set 4621724/320.200 - 1000 nM3VJK-M51 Bioorg Med Chem 2012 20:5705-19 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:2618-21 2D 3D TSV
Set 4634919/280.260 - 50000 nM3Q0T-LGE 3SWW-KXB 3SX4-KXA Bioorg Med Chem Lett 2011 21:6646-51 ACS Med Chem Lett 2010 1:530-535 Bioorg Med Chem 2009 17:1783-802 2D 3D TSV
Set 464624/3012.0 - 77.0 nM3H0C-PS4 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:4201-3 2D 3D TSV
Set 4654419/280.200 - 810 nM3NOX-6A5 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:4395-8 J Med Chem 2010 53:5620-8 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:6273-6 2D 3D TSV
Set 4663120/251.10 - 73.0 nM3O95-01T 3O9V-10T Bioorg Med Chem 2011 19:172-85 J Med Chem 2012 54:831-50 2D 3D TSV
Set 467928/291.80 - 110 nM3WQH-SKK Bioorg Med Chem 2011 19:7221-7 2D 3D TSV
Set 4682417/2011.0 - 40000 nM3CCC-7AC Bioorg Med Chem Lett 2008 18:2362-7 2D 3D TSV
Set 4692023/242.80 - 2800 nM4G1F-0WG Bioorg Med Chem Lett 2012 22:6628-31 2D 3D TSV
DNA gyrase subunit B
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 4704532/5014.0 - 10000 nM1KZN-CBN Antimicrob Agents Chemother 2008 52:1982-90 27689732J Med Chem 2008 51:5243-63 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:1461-4 J Med Chem 2011 54:915-29 2D 3D TSV
DNA polymerase beta
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 4711421/32600 - 1000000 nM8ICJ-TTP 8ICO-AZT 8ICW-TTP 8ICX-TTP 8ICY-TTP 9ICU-TTP J Nat Prod 1997 59:839-42 J Med Chem 1998 41:2040-6 J Nat Prod 2005 68:979-84 J Med Chem 2008 51:6460-70 J Med Chem 2017 60:5424-5437 Bioorg Med Chem Lett 2017 27:1840-1847 J Nat Prod 1995 58:1024-1031 2D 3D TSV
Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 4725619/290.007 - 1700 nM3DV3-MEK 3VVH-4BM Nat Biotechnol 2011 29:1046-51 ACS Med Chem Lett 2012 3:416-421 J Med Chem 2016 59:2512-22 US8575391 J Med Chem 2013 56:1363-88 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:1795-801 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:2555-9 J Med Chem 2012 55:4594-604 2D 3D TSV
Set 4731421/250.007 - 10000 nM3V04-V04 ACS Med Chem Lett 2012 3:416-421 J Med Chem 2016 59:2512-22 US8575391 J Med Chem 2013 56:1363-88 J Med Chem 2012 55:4594-604 2D 3D TSV
Set 4741722/301.80 - 4500 nM4LMN-EUI ACS Med Chem Lett 2012 3:416-421 J Med Chem 2012 55:4594-604 2D 3D TSV
Dual specificity protein kinase TTK
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 47510420/271.00 - 2500 nM3WZK-O23 J Med Chem 2015 58:1760-75 Bioorg Med Chem Lett 2016 26:3562-6 US9468642 US9199999 US9284317 US9212184 J Med Chem 2015 58:3366-92 2D 3D TSV
Set 4764423/350.200 - 380 nM3WZJ-O43 US9512126 J Med Chem 2015 58:1760-75 Bioorg Med Chem Lett 2016 26:3562-6 ACS Med Chem Lett 2015 6:7-8 J Med Chem 2015 58:3366-92 2D 3D TSV
Set 4773230/4919.0 - 10000 nM2X9E-SVE US9333205 US8916577 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:4507-11 US8975267 2D 3D TSV
Set 4782019/2821.0 - 18000 nM3W1F-1O5 J Med Chem 2013 56:4343-56 Bioorg Med Chem 2014 22:4968-97 2D 3D TSV
Set 4793823/351.10 - 340 nM4O6L-2QK Bioorg Med Chem 2014 22:4968-97 J Med Chem 2015 58:3366-92 2D 3D TSV
Dual-specificity tyrosine-phosphorylation regulated kinase 1A
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 4802519/2118.0 - 10000 nM4YLJ-4E1 4YLK-4E2 4YLL-4E3 J Med Chem 2015 58:3131-43 2D 3D TSV
Set 4813023/375.00 - 6500 nM4MQ1-2C3 4MQ2-2C4 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:6610-5 2D 3D TSV
dUTP pyrophosphatase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 482623/35200 - 310000 nM3T60-DUA J Med Chem 2005 48:5942-54 Eur J Med Chem 2009 44:678-88 2D 3D TSV
Set 483622/371800 - 520000 nM1VYQ-DUX J Med Chem 2005 48:5942-54 J Med Chem 2006 49:4183-95 2D 3D TSV
E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 48418724/520.059 - 30000 nM2LZG-13Q 4ERF-0R3 4OAS-2SW 4OBA-2TW 4OCC-2TZ 4ODE-2U0 4ODF-2U1 4OGN-2U5 4OGT-2U6 4OGV-2U7 4QOC-35T 4WT2-3UD J Med Chem 2014 57:1454-72 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:3782-5 J Med Chem 2013 56:4053-70 J Med Chem 2014 57:10499-511 J Med Chem 2014 57:2963-88 J Med Chem 2012 55:4936-54 J Med Chem 2014 57:2472-88 2D 3D TSV
Set 4858230/501.20 - 71000 nM4ZYF-4T4 US9051279 2D 3D TSV
Set 4868720/320.150 - 50000 nM3TJ2-TJ2 4MDN-Y30 US9187441 Bioorg Med Chem 2013 21:3982-95 J Med Chem 2015 58:1038-52 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:2546-54 Eur J Med Chem 2017 126:384-407 2D 3D TSV
Set 4871821/35400 - 25000 nM4MDQ-28W US9187441 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:2546-54 2D 3D TSV
Set 48835928/422.40 - 100000 nM3LBL-MI6 J Med Chem 2014 57:10486-98 ACS Med Chem Lett 2014 5:124-7 J Med Chem 2014 57:1454-72 US9701685 J Med Chem 2014 56:5553-61 US9079913 J Med Chem 2015 58:1038-52 J Med Chem 2014 56:5979-83 US8629141 US8680132 J Med Chem 2017 60:2819-2839 J Med Chem 2006 49:3759-62 US8993614 J Med Chem 2009 52:7970-3 J Med Chem 2013 56:4053-70 J Med Chem 2006 49:3432-5 2D 3D TSV
Set 4897128/3480.0 - 100000 nM1T4E-DIZ Bioorg Med Chem Lett 2005 15:1857-61 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:3310-4 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:3463-8 Bioorg Med Chem 2012 20:1979-89 Bioorg Med Chem 2013 21:3982-95 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:3115-20 Eur J Med Chem 2012 56:10-16 2D 3D TSV
Set 4904622/331.00 - 30000 nM4JV7-1MN 4JV9-1MO 4JWR-1MY J Med Chem 2013 56:4053-70 J Med Chem 2014 57:2963-88 J Med Chem 2014 57:2472-88 2D 3D TSV
Egl nine homolog 1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 4914816/21220 - 400000 nM2G19-4HG 2G1M-4HG 2HBT-UN9 2HBU-UN9 2Y33-UN9 2Y34-UN9 3HQU-UN9 4BQX-UN9 4BQY-FNT J Med Chem 2010 53:867-75 US9708269 US9409892 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:5953-7 US9695170 ACS Med Chem Lett 2015 6:1236-40 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:5023-6 2D 3D TSV
Set 492516/1625000 - 100000 nM3OUI-42Z ACS Med Chem Lett 2010 1:526-529 2D 3D TSV
Set 493817/1879.4 - 1000 nM3OUH-014 J Med Chem 2014 56:9369-402 ACS Med Chem Lett 2010 1:526-529 2D 3D TSV
Endochitinase B1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 494713/18200 - 1500000 nM2A3A-TEP 2A3B-CFF 2A3C-PNX ACS Med Chem Lett 2011 2:428-432 Chem Biol 2005 12:973-80 2D 3D TSV
Set 495525/3217.0 - 5100 nM3CHD-WRG Chem Biol 2008 15:295-301 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4717-21 2D 3D TSV
Enoyl-ACP Reductase (FabI)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 4962922/302700 - 50000 nM1I30-826 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:2241-4 2D 3D TSV
Enoyl-ACP Reductase (InhA)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 4972614/225.00 - 1000000 nM2B36-5PP 2B37-8PS 2X22-TCU 2X23-TCU 4OXY-1TN Eur J Med Chem 2012 52:275-83 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:3029-33 J Med Chem 2013 56:8533-42 ACS Chem Biol 2006 1:43-53 2D 3D TSV
Set 498614/212000 - 14000 nM2NSD-4PI Eur J Med Chem 2015 90:436-47 Bioorg Med Chem 2007 15:6649-58 2D 3D TSV
Set 4991921/30180 - 50000 nM1P44-GEQ Eur J Med Chem 2015 90:436-47 Bioorg Med Chem 2007 15:6649-58 2D 3D TSV
Set 500428/294.00 - 9300 nM4BQP-VMY J Med Chem 2013 56:8533-42 2D 3D TSV
Set 5015628/342.00 - 1300 nM4COD-KV1 J Med Chem 2014 57:1276-88 2D 3D TSV
Enoyl-ACP Reductase (PfENR)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5021216/1649.0 - 480 nM1UH5-TCL J Biol Chem 2007 282:25436-44 2D 3D TSV
Enoyl-acyl carrier reductase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 503914/173.00 - 2800 nM2O2S-TCL J Med Chem 2010 53:6287-300 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:2035-43 Biochemistry 2013 52:9155-66 2D 3D TSV
Enoyl-acyl-carrier protein reductase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5041715/1649.0 - 7000 nM1NHG-TCL J Biol Chem 2007 282:25436-44 Eur J Med Chem 2009 44:3009-19 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:5247-52 2D 3D TSV
Epidermal growth factor receptor
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 50552518/290.072 - 100000 nM1M17-AQ4 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:5389-94 J Med Chem 2002 45:3865-77 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:6301-5 Bioorg Med Chem 2015 23:7340-7 Bioorg Med Chem 2015 22:6796-805 J Med Chem 2002 45:1300-12 Bioorg Med Chem 2016 24:3501-12 US10106508 J Med Chem 2005 48:7445-56 US9796704 Eur J Med Chem 2015 102:445-63 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:637-40 J Med Chem 2001 43:1380-97 J Med Chem 2010 53:2000-9 J Med Chem 1996 39:267-76 J Med Chem 2009 52:964-75 Eur J Med Chem 2017 130:393-405 J Med Chem 2010 53:1413-37 J Enzyme Inhib Med Chem 2014 29:215-22 Nat Biotechnol 2008 26:127-32 J Med Chem 2006 49:3544-52 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:1349-56 J Med Chem 2010 53:2892-901 Eur J Med Chem 2017 127:442-458 J Med Chem 2014 57:4598-605 J Med Chem 2005 48:5337-48 Eur J Med Chem 2017 125:245-254 J Med Chem 2012 55:1189-204 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:2893-7 Eur J Med Chem 2016 109:371-9 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:6373-7 J Med Chem 2016 59:8103-24 Eur J Med Chem 2014 89:826-34 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:1911-4 US10196365 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:2106-12 Bioorg Med Chem 2013 21:1857-64 Bioorg Med Chem 1996 4:1203-7 Bioorg Med Chem 2016 24:2871-2881 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:884-7 Eur J Med Chem 2014 71:1-14 J Med Chem 2008 51:1179-88 Bioorg Med Chem 2012 20:6144-53 Bioorg Med Chem 2010 18:870-9 J Enzyme Inhib Med Chem 2010 25:158-71 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4226-9 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:4908-12 Eur J Med Chem 2013 61:84-94 Proc Natl Acad Sci USA 2007 104:20523-8 Eur J Med Chem 2016 110:195-203 2D 3D TSV
Set 5066432/3817.0 - 760000 nM2ITW-STO Nat Biotechnol 2011 29:1046-51 Bioorg Med Chem Lett 1999 9:1219-24 Blood 2009 114:2984-92 PubChem BioAssay aid1433 Eur J Med Chem 2010 45:3389-93 Nat Biotechnol 2008 26:127-32 2D 3D TSV
Set 5072623/343.30 - 4600 nM2J6M-AEE Eur J Med Chem 2011 46:6002-14 J Med Chem 2013 56:3889-903 2D 3D TSV
Set 5084323/372.00 - 11000000 nM4ZAU-YY3 J Med Chem 2017 60:2361-2372 J Med Chem 2015 58:6844-63 J Med Chem 2014 57:8249-67 ACS Med Chem Lett 2015 6:987-92 US10085983 Bioorg Med Chem Lett 2016 26:1861-8 2D 3D TSV
Set 50932716/230.003 - 100000 nM2J5F-DJK Bioorg Med Chem 2015 23:7340-7 US9725439 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:5870-5 Bioorg Med Chem Lett 2017 27:1341-1345 Bioorg Med Chem 2016 24:3501-12 J Med Chem 1997 40:3915-25 Bioorg Med Chem 2007 15:3635-48 Chem Biol Drug Des 2008 71:374-9 J Med Chem 2002 46:49-63 Nat Rev Drug Discov 2017 16:424-440 J Med Chem 2001 43:1380-97 J Med Chem 1996 39:267-76 J Med Chem 2009 52:964-75 J Med Chem 1999 42:5464-74 Eur J Med Chem 2017 130:393-405 US8846699 J Med Chem 2006 49:3544-52 J Med Chem 1996 39:918-28 J Med Chem 2010 53:2892-901 J Med Chem 1995 38:3482-7 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:1135-8 Bioorg Med Chem 2011 19:5012-22 Bioorg Med Chem 2011 20:317-23 J Med Chem 2005 48:5337-48 Bioorg Med Chem 2012 20:4217-25 J Med Chem 2012 55:1189-204 Eur J Med Chem 2015 102:115-31 J Med Chem 1996 39:1823-35 J Med Chem 1998 41:742-51 Bioorg Med Chem 2011 19:429-39 Eur J Med Chem 2013 61:132-45 J Med Chem 2017 60:2853-2868 J Med Chem 2016 59:8103-24 Eur J Med Chem 2008 43:781-91 J Med Chem 2014 57:9889-900 J Med Chem 2006 49:6642-5 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:2106-12 J Med Chem 2012 55:6243-62 J Med Chem 2001 44:429-40 J Med Chem 2003 46:4313-21 Bioorg Med Chem 2013 21:1857-64 J Med Chem 2012 55:2251-64 Nat Chem Biol 2007 3:229-38 Bioorg Med Chem 1996 4:1203-7 J Med Chem 1995 38:3780-8 J Med Chem 1999 42:1803-15 J Med Chem 2001 44:2719-34 Eur J Med Chem 2012 49:271-8 J Med Chem 2010 53:2038-50 J Med Chem 2008 51:1179-88 Eur J Med Chem 2016 117:283-91 J Med Chem 2006 49:1475-85 Proc Natl Acad Sci USA 2007 104:20523-8 2D 3D TSV
Set 51065220/350.037 - 100000 nM4G5J-0WM 4I23-1C9 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:2893-7 Bioorg Med Chem 2016 24:3359-70 Bioorg Med Chem 2013 21:7988-98 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:6301-5 US9187459 US9725439 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:5870-5 J Med Chem 2016 59:8103-24 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:1911-4 Eur J Med Chem 2008 43:781-91 Bioorg Med Chem 2016 24:3501-12 US10196365 US10106508 J Med Chem 2014 57:9889-900 J Med Chem 2012 55:6243-62 US9796704 J Med Chem 2005 48:1107-31 J Med Chem 2012 55:2251-64 Eur J Med Chem 2015 102:445-63 US9730934 Nat Rev Drug Discov 2017 16:424-440 J Med Chem 2001 43:1380-97 J Med Chem 2010 53:2000-9 US8623883 Bioorg Med Chem 2016 24:2871-2881 J Med Chem 2009 52:964-75 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:884-7 Bioorg Med Chem 2010 18:6634-45 US8846699 Bioorg Med Chem 2010 18:870-9 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:1633-7 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:4908-12 US9358227 US9714235 J Med Chem 2006 49:1475-85 J Med Chem 2016 59:2005-24 Eur J Med Chem 2013 61:84-94 Bioorg Med Chem 2016 24:1495-503 J Med Chem 2009 52:6880-8 Bioorg Med Chem Lett 2016 26:1571-5 J Med Chem 2005 48:5337-48 Eur J Med Chem 2017 125:245-254 Bioorg Med Chem 2009 17:3152-61 J Med Chem 2012 55:1189-204 Bioorg Med Chem 2007 15:3635-48 J Med Chem 2002 46:49-63 Eur J Med Chem 2017 130:393-405 Bioorg Med Chem 2011 19:5012-22 Eur J Med Chem 2015 102:115-31 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:5147-54 Bioorg Med Chem 2017 25:27-37 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:2106-12 J Med Chem 2001 44:429-40 J Med Chem 1999 42:1803-15 J Med Chem 2001 44:2719-34 Eur J Med Chem 2012 49:271-8 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:2672-6 2D 3D TSV
Set 5112720/3226.0 - 2500 nM5EM8-5Q4 ACS Med Chem Lett 2016 7:100-4 2D 3D TSV
Set 5125220/380.400 - 25000 nM4JQ7-KJQ 4JQ8-KJ8 4JR3-KJR 4JRV-KJV J Med Chem 2010 53:4980-8 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:2305-9 Eur J Med Chem 2016 119:278-99 J Med Chem 2013 56:3889-903 2D 3D TSV
Set 5132621/305.00 - 310 nM3BEL-POX Bioorg Med Chem Lett 2008 18:4615-9 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:3495-9 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:2828-33 2D 3D TSV
Set 514726/3519.0 - 110 nM3W32-W32 3W33-W19 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:1601-6 Bioorg Med Chem 2013 21:2250-61 2D 3D TSV
Set 5157325/401.00 - 2300 nM1XKK-FMM Eur J Med Chem 2014 87:631-42 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:5147-54 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:4686-91 J Med Chem 2010 53:8546-55 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:817-20 US8916574 Bioorg Med Chem Lett 2017 27:1584-1587 Eur J Med Chem 2015 95:76-95 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:111-4 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:637-40 Bioorg Med Chem 2016 24:3501-12 2D 3D TSV
Set 5163626/381.90 - 2300 nM3POZ-03P 3W2S-W2R J Biol Chem 2011 286:18756-65 ACS Med Chem Lett 2013 4:201-5 J Med Chem 2012 55:3975-91 Bioorg Med Chem 2012 20:6171-80 Bioorg Med Chem 2013 21:2250-61 2D 3D TSV
Epoxide hydratase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 51712118/280.400 - 50000 nM4HAI-I23 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:2354-9 Bioorg Med Chem Lett 2012 23:417-21 US9139593 Bioorg Med Chem Lett 2011 22:601-5 2D 3D TSV
Set 51810911/180.500 - 500000 nM1ZD2-NC3 1ZD3-NC4 1ZD4-NC6 J Med Chem 2007 50:3825-40 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:5889-92 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:2193-7 J Med Chem 2003 46:1066-80 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:5439-44 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:2380-3 J Med Chem 2004 47:2110-22 J Med Chem 2005 48:3621-9 J Med Chem 2007 50:5217-26 Bioorg Med Chem 2011 19:5585-95 PubChem BioAssay aid1026 J Med Chem 2010 53:7067-75 Bioorg Med Chem 2006 15:312-23 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:5212-6 Bioorg Med Chem 2012 20:3255-62 J Med Chem 2010 52:5069-75 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:983-8 2D 3D TSV
Set 5193520/320.500 - 330 nM5AM3-AUB 3WKE-AUB Bioorg Med Chem Lett 2013 23:3732-7 J Med Chem 2007 50:3825-40 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:5773-7 US9029401 Bioorg Med Chem 2012 20:3255-62 J Med Chem 2004 47:2110-22 2D 3D TSV
Set 52013315/250.020 - 50000 nM4OCZ-2RU 4OD0-2RV J Med Chem 2010 53:7067-75 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:3732-7 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:5975-9 J Med Chem 2014 57:7016-30 Bioorg Med Chem 2012 20:3255-62 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:565-70 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:983-8 Bioorg Med Chem 2011 19:5585-95 J Med Chem 2007 50:3825-40 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3703-7 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:1784-9 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:571-5 J Med Chem 2005 48:3621-9 J Med Chem 2003 46:1066-80 J Med Chem 2010 53:8376-8386 US9029401 2D 3D TSV
Set 5214414/150.500 - 130000 nM3WK4-S0A J Med Chem 2010 53:7067-75 Bioorg Med Chem Lett 2014 24:2193-7 J Med Chem 2003 46:1066-80 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:1784-9 J Med Chem 2014 57:7016-30 Bioorg Med Chem 2012 20:3255-62 Bioorg Med Chem 2013 21:2587-99 ACS Med Chem Lett 2016 7:341-4 J Med Chem 2005 48:3621-9 Bioorg Med Chem 2011 19:5585-95 2D 3D TSV
Set 5225418/391.00 - 100 nM4X6X-S74 4X6Y-S94 5AM1-I5T Bioorg Med Chem Lett 2015 25:1705-8 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:3398-404 Bioorg Med Chem 2014 22:1548-57 J Med Chem 2010 53:7067-75 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:5314-20 2D 3D TSV
Set 5231621/257.00 - 1200 nM3ANT-S82 J Med Chem 2010 52:5009-12 2D 3D TSV
Set 524925/325.00 - 23.0 nM3I28-34N J Med Chem 2009 52:5880-95 2D 3D TSV
Set 5251515/245.00 - 700 nM3I1Y-33N Bioorg Med Chem Lett 2009 19:5864-8 J Med Chem 2009 52:5880-95 2D 3D TSV
Set 5262318/233.90 - 220 nM3KOO-24D Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3703-7 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:571-5 2D 3D TSV
Set 527918/275.00 - 650 nM3OTQ-MZL Bioorg Med Chem Lett 2010 20:6379-83 2D 3D TSV
Set 5282721/291.00 - 1600 nM4JNC-1LF Bioorg Med Chem Lett 2013 23:3584-8 2D 3D TSV
Estrogen receptor
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 529822/230.620 - 70000 nM2J7X-EST J Med Chem 1984 27:1131-7 J Med Chem 1989 32:1642-52 2D 3D TSV
Estrogen-related receptor gamma
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5305126/315.00 - 10000 nM1S9Q-OHT 1VJB-OHT 2EWP-TXF 2GPU-OHT 2GPV-OHT 2P7Z-OHT Bioorg Med Chem 2017 25:1585-1599 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:821-4 Eur J Med Chem 2016 120:338-52 2D 3D TSV
Estrogen-Related Receptor, gamma
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 531717/1713.0 - 6500 nM1S9P-DES Bioorg Med Chem 2017 25:1585-1599 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:821-4 Eur J Med Chem 2016 120:338-52 2D 3D TSV
Eukaryotic translation initiation factor 4E
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5324528/3745.0 - 69000 nM1L8B-MGP 5BXV-MGP Bioorg Med Chem 2015 23:5369-81 J Med Chem 2012 55:3837-51 Eur J Med Chem 2010 45:1304-13 Bioorg Med Chem 2012 20:1699-710 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:1921-5 2D 3D TSV
Eukaryotic translation initiation factor 4E (eIF4E)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5334522/3628.0 - 400000 nM1IPC-MGP 2V8X-MGQ 3AM7-MGP 4TPW-MGP Bioorg Med Chem Lett 2005 15:2177-80 J Med Chem 2012 55:3837-51 J Med Chem 2017 60:8131-8144 2D 3D TSV
Set 534628/3216.0 - 300000 nM4DUM-HLI J Med Chem 2012 55:3837-51 2D 3D TSV
Farnesyl diphosphate synthase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5351111/1616.4 - 820000 nM3RYE-UNR J Med Chem 2003 46:5171-83 Bioorg Med Chem 2012 20:5583-91 J Med Chem 2013 56:7939-50 J Med Chem 2007 50:5967-75 J Med Chem 2008 51:2187-95 2D 3D TSV
Set 5364511/190.620 - 150000 nM2F89-210 2F92-212 2F94-BFQ J Med Chem 2003 46:5171-83 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:3231-5 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:4685-90 J Med Chem 2003 46:2932-44 J Med Chem 2008 51:2187-95 2D 3D TSV
Set 5373810/165.00 - 60000 nM2F8C-ZOL 2F8Z-ZOL 2F9K-ZOL 3N45-ZOL 3N46-ZOL 4P0V-ZOL 4P0W-ZOL J Med Chem 2003 46:5171-83 ACS Med Chem Lett 2013 4:423-427 J Med Chem 2003 46:2932-44 J Med Chem 2008 51:6800-7 2D 3D TSV
Set 538516/165.10 - 10000 nM3B7L-M0N J Med Chem 2003 46:5171-83 J Med Chem 2003 46:2932-44 J Med Chem 2010 53:3454-64 2D 3D TSV
FK506 binding protein 4
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5394533/44710 - 1000000 nM4LAY-I63 J Med Chem 2012 55:4114-22 J Med Chem 2015 58:7796-806 J Med Chem 2012 55:4123-31 2D 3D TSV
Focal adhesion kinase 1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5402723/32470 - 100000 nM4K9Y-K9Y 4KAO-KAO Bioorg Med Chem Lett 2012 22:7523-9 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:5401-9 Nat Biotechnol 2008 26:127-32 2D 3D TSV
Set 54111722/284.00 - 10000 nM2ETM-7PY Bioorg Med Chem Lett 2006 16:2689-92 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:2173-6 2D 3D TSV
Set 5423023/350.500 - 10000 nM3BZ3-YAM Bioorg Med Chem Lett 2008 18:6071-7 Bioorg Med Chem Lett 2016 26:5926-5930 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:3253-8 2D 3D TSV
Set 5431722/311300 - 57000 nM4GU6-10N J Med Chem 2013 56:1160-70 2D 3D TSV
Set 5441416/25420 - 30000 nM4EBV-0O7 4EBW-0PF 4I4F-1BR Eur J Med Chem 2013 61:49-60 Bioorg Med Chem Lett 2013 23:1779-85 2D 3D TSV
Fructose-bisphosphate aldolase A
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 545821/257500 - 240000 nM1ZAJ-M2P 3TU9-5MM ACS Med Chem Lett 2011 2:804-808 2D 3D TSV
GABA-B receptor 1/2
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 546413/151000 - 180000 nM4MS4-2C0 J Med Chem 1995 38:3297-312 J Med Chem 2015 58:6336-47 J Med Chem 2013 56:2456-65 2D 3D TSV
Galectin-1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5471832/3623000 - 180000 nM4Q26-NLC J Med Chem 2013 56:1350-4 US8703720 J Med Chem 2008 51:8109-14 Bioorg Med Chem 2006 14:1215-20 2D 3D TSV
Set 548533/336400 - 17000 nM3OYW-TDG J Med Chem 2008 51:8109-14 2D 3D TSV
Set 549827/2914000 - 4400000 nM3T2T-MQT Bioorg Med Chem Lett 2008 18:3691-4 J Med Chem 2008 51:8109-14 2D 3D TSV
Galectin-3
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 550640/5333.0 - 4300 nM4BLJ-70B Bioorg Med Chem 2010 18:5367-78 Bioorg Med Chem 2008 16:7811-23 US8703720 J Med Chem 2008 51:8109-14 2D 3D TSV
Set 551531/331.10 - 220000 nM4R9A-LAT 4R9B-LAT 4R9C-LAT 4R9D-LAT 4RL7-LAT 3ZSJ-LAT 2NN8-LAT Bioorg Med Chem Lett 2014 24:3516-20 Bioorg Med Chem 2008 16:7811-23 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:1265-9 2D 3D TSV
Set 552533/331600 - 11000 nM4JC1-TDG J Med Chem 2008 51:8109-14 2D 3D TSV
Set 553827/292500 - 2500000 nM3T1L-MQT Bioorg Med Chem Lett 2008 18:3691-4 J Med Chem 2008 51:8109-14 2D 3D TSV
Geranylgeranyl transferase type I beta subunit/Protein Farnesyltransferase (PFT)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 55413821/290.110 - 950000 nM1S63-778 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:537-40 J Med Chem 2002 45:2388-409 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:1817-21 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:1257-60 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:1411-5 J Med Chem 1999 42:3779-84 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:639-43 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:865-9 J Med Chem 2001 44:2933-49 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:767-71 J Med Chem 2004 47:1869-78 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:1269-73 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:2027-30 2D 3D TSV
Set 5552624/355.10 - 10000 nM1MZC-BNE J Med Chem 2003 46:2973-84 2D 3D TSV
Glucokinase regulatory protein
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5564621/354.00 - 25000 nM4MQU-MG9 4OHM-2TF 4OHO-2TG 4OHP-2TJ J Med Chem 2014 57:3094-116 J Med Chem 2014 57:309-24 2D 3D TSV
Set 5572427/379.70 - 9200 nM4LY9-1YY 4MSU-2EU J Med Chem 2014 57:309-24 2D 3D TSV
Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase (RmlA)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5581315/2773.0 - 60000 nM3ZLK-Y46 4ARW-HNR 4ASJ-N6A 4B3U-NWL 4B4G-KKT 4B4M-JWT 4B5B-BBE ACS Chem Biol 2013 8:387-96 2D 3D TSV
Set 559518/18100 - 60000 nM4ASY-N5Y ACS Chem Biol 2013 8:387-96 2D 3D TSV
Glutamate carboxypeptidase II
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 560910/150.100 - 1200 nM2JBJ-G88 2PVW-G88 J Med Chem 2013 56:7890-901 J Med Chem 2012 55:9510-20 J Med Chem 2003 46:1989-96 2D 3D TSV
Set 561817/2144.0 - 5000 nM5D29-5Q1 5ELY-5PU J Med Chem 2017 60:7799-7809 J Med Chem 2006 49:2876-85 J Med Chem 2016 59:4539-50 2D 3D TSV
Set 5627221/960.010 - 1000000 nM3D7H-YC2 3IWW-YZE 3SJF-JRG 4NGM-JB7 4NGR-J21 4NGT-J42 4OC0-2R7 4OC2-2QQ 4OC3-2QP 4OC4-2QN 4OC5-2QM J Med Chem 2015 58:4357-63 Bioorg Med Chem 2014 22:4099-108 J Med Chem 2009 52:347-57 J Med Chem 2011 54:7535-46 J Med Chem 2013 56:7890-901 J Med Chem 2012 55:9510-20 J Med Chem 2008 51:7933-43 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:392-7 2D 3D TSV
Set 5631626/960.110 - 28.0 nM4NGP-J31 4NGS-J34 J Med Chem 2015 58:4357-63 Bioorg Med Chem 2014 22:4099-108 J Med Chem 2009 52:347-57 2D 3D TSV
Set 564828/42400 - 27000 nM4JYW-T57 4LQG-CTW Bioorg Med Chem Lett 2015 25:2536-9 2D 3D TSV
Set 5651320/2835.0 - 360000 nM4P4B-2G2 Bioorg Med Chem 2007 15:7434-43 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:2536-9 2D 3D TSV
Set 566620/26390 - 1000000 nM3D7F-YBY J Med Chem 2009 52:347-57 J Med Chem 2012 55:9510-20 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:392-7 2D 3D TSV
Glutamate racemase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5674928/3213.0 - 900 nM4B1F-KRH Bioorg Med Chem Lett 2012 22:5600-7 2D 3D TSV
Set 5681817/26600 - 400000 nM2W4I-VGA Bioorg Med Chem Lett 2009 19:930-6 2D 3D TSV
Glutaminyl Cyclase
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 56910116/220.700 - 18000 nM3PBB-PBD US9656991 J Med Chem 2017 60:2573-2590 Bioorg Med Chem 2013 21:3821-30 US9512082 J Med Chem 2009 52:7069-80 J Med Chem 2006 49:664-77 2D 3D TSV
Glycogen Phosphorylase (PYGL)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 57015219/3012.0 - 20000 nM1EXV-700 1L5Q-700 1L5R-700 1L5S-700 1L7X-700 J Med Chem 1998 41:2934-8 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3511-4 Bioorg Med Chem Lett 2004 15:459-65 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:5567-71 Bioorg Med Chem 2016 24:5423-5430 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:4385-8 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:394-9 Bioorg Med Chem 2011 19:4746-71 J Med Chem 2004 47:3537-45 2D 3D TSV
Set 57110223/393.00 - 100000 nM3DD1-25D 3DDS-26B Bioorg Med Chem Lett 2009 19:981-5 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:4068-71 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:976-80 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:1177-82 2D 3D TSV
Set 5723615/2320.0 - 10000 nM2ZB2-A46 Bioorg Med Chem 2008 16:10001-12 Bioorg Med Chem 2008 16:5452-64 2D 3D TSV
Set 5733619/2350.1 - 15000 nM2ATI-IHU J Med Chem 2005 48:6178-93 2D 3D TSV
Glycogen Phosphorylase (PYGM)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5741625/27630 - 800000 nM2QRG-M07 2QRH-M08 J Med Chem 2012 55:1287-95 Eur J Med Chem 2016 108:444-54 Bioorg Med Chem 2009 17:7368-80 2D 3D TSV
Glycogen phosphorylase, muscle form
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 57512228/421100 - 1700000 nM2QN1-0AS J Nat Prod 2011 71:1877-80 Bioorg Med Chem Lett 2005 16:722-6 Eur J Med Chem 2011 46:2011-21 J Med Chem 2008 51:3540-54 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:6966-9 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:2915-9 J Nat Prod 2009 72:1414-8 Bioorg Med Chem Lett 2010 21:338-41 2D 3D TSV
Set 5767218/32350 - 4500000 nM2F3P-4GP 2F3Q-6GP 2F3S-7GP 2F3U-8GP 3CUT-179 3CUU-376 3CUV-475 3CUW-445 3G2J-9GP 3G2N-OAK 3ZCR-F85 3ZCT-VMP 3ZCU-T68 3ZCV-N85 4MHO-26M 4MHS-26Q 4MI6-26V 4MI9-26W 4MIC-26Y Bioorg Med Chem 2010 18:1171-80 Eur J Med Chem 2016 108:444-54 Bioorg Med Chem 2013 21:5738-47 Bioorg Med Chem 2009 17:4773-85 Bioorg Med Chem 2014 22:4810-25 ACS Med Chem Lett 2013 4:612-5 Bioorg Med Chem 2012 20:1801-16 Bioorg Med Chem 2009 17:6738-41 J Med Chem 2012 55:1287-95 2D 3D TSV
Set 5772819/29350 - 4500000 nM2QLM-F68 2QLN-F59 2QN3-F55 2QNB-BZD 3ZCQ-62N J Med Chem 2012 55:1287-95 Bioorg Med Chem 2013 21:5738-47 Bioorg Med Chem 2009 17:4773-85 Bioorg Med Chem 2014 22:4810-25 Bioorg Med Chem 2012 20:1801-16 2D 3D TSV
Set 5781420/291000 - 6600000 nM3BCS-CJB 3BD7-CKB 3BD8-C3B 3T3D-CJB 3T3E-GPQ 4EJ2-D1F 4EKY-D1J 4EL5-D1M J Med Chem 2012 55:1287-95 Eur J Med Chem 2012 54:740-9 J Med Chem 2017 60:9251-9262 Bioorg Med Chem 2010 18:3413-25 2D 3D TSV
Set 5791120/3126000 - 780000 nM3G2H-KOT 3G2I-RUG 3G2K-SKY 3G2L-LEW Bioorg Med Chem 2010 18:1171-80 ACS Med Chem Lett 2013 4:612-5 J Med Chem 2017 60:9251-9262 2D 3D TSV
Set 580524/2540000 - 980000 nM2FET-H53 2FF5-H53 3NP7-Z15 3NP7-Z16 3NP9-Z2T 3NPA-Z57 3S0J-Z15 Bioorg Med Chem 2011 19:5125-36 2D 3D TSV
Glycogen synthase kinase-3 beta
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5813520/320.100 - 690 nM4ACC-7YG 4ACD-GR9 4ACH-KDI US9452998 J Med Chem 2012 55:9107-19 2D 3D TSV
Set 582733/3869.0 - 10000 nM1Q3D-STO Nat Biotechnol 2011 29:1046-51 Blood 2009 114:2984-92 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:1661-4 PubChem BioAssay aid1433 Nat Biotechnol 2008 26:127-32 2D 3D TSV
Set 58314618/290.053 - 7200 nM1R0E-DFN 3SD0-TSK J Med Chem 2003 46:4021-31 Nat Biotechnol 2011 29:1046-51 J Med Chem 2011 54:284-8 Bioorg Med Chem 2009 17:4302-12 Eur J Med Chem 2009 44:2361-71 J Med Chem 2009 52:1853-63 Nat Biotechnol 2008 26:127-32 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:1693-6 Chem Biol Drug Des 2015 86:746-52 Bioorg Med Chem 2015 23:1179-88 US8957103 J Med Chem 2005 48:1725-8 US9364459 J Med Chem 2012 55:9531-40 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:3049-53 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:5686-9 Trends Pharmacol Sci 2004 25:471-80 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:3245-50 Bioorg Med Chem Lett 2007 17:2863-8 J Med Chem 2012 55:9107-19 2D 3D TSV
Set 5842432/322.00 - 2500 nM3I4B-Z48 J Med Chem 2009 52:6362-8 2D 3D TSV
Set 5853217/23250 - 63000 nM4AFJ-SJJ Bioorg Med Chem Lett 2012 22:1989-94 2D 3D TSV
Set 586519/230.830 - 30.0 nM4PTG-2WG Bioorg Med Chem Lett 2015 25:1856-63 2D 3D TSV
Set 587718/227.50 - 730 nM4PTE-2WF Bioorg Med Chem Lett 2015 25:1856-63 2D 3D TSV
Set 5883521/342.00 - 25000 nM2O5K-HBM Bioorg Med Chem Lett 2007 17:5686-9 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:1891-4 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:4221-4 Eur J Med Chem 2009 44:2361-71 2D 3D TSV
Set 5891816/2379.4 - 100000 nM3ZRL-ZRL 3ZRM-ZRM Bioorg Med Chem Lett 2011 21:4823-7 2D 3D TSV
Set 5905118/192.50 - 1000000 nM1Q3W-ATU Eur J Med Chem 2010 45:335-42 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:1693-6 Chembiochem 2005 6:541-9 Trends Pharmacol Sci 2004 25:471-80 Proc Natl Acad Sci USA 2007 104:20523-8 2D 3D TSV
Set 5917320/2420.0 - 2600 nM1Q4L-679 J Med Chem 2008 51:2062-77 J Nat Prod 2011 74:99-101 276897292D 3D TSV
Set 5924618/244.90 - 300000 nM3F7Z-34O J Med Chem 2015 58:8907-19 J Med Chem 2012 55:4407-24 Bioorg Med Chem 2009 17:2017-29 PubChem BioAssay aid434954 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:1525-8 2D 3D TSV
Grb2-SH2
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5935232/520.075 - 600000 nM1X0N-DTF J Med Chem 2005 48:764-72 J Med Chem 2003 46:2621-30 Bioorg Med Chem Lett 2001 10:2337-41 Bioorg Med Chem Lett 1999 9:221-6 J Med Chem 2011 54:1096-100 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:1889-92 J Med Chem 2011 54:1961-2004 J Med Chem 2004 47:788-91 J Med Chem 1999 42:25-35 J Med Chem 2004 47:2166-9 Bioorg Med Chem Lett 2001 11:1201-3 Bioorg Med Chem Lett 2002 12:2781-4 Bioorg Med Chem Lett 2006 16:5265-9 Bioorg Med Chem Lett 2000 10:669-72 J Med Chem 2007 50:1978-82 J Med Chem 2000 43:911-20 J Med Chem 2003 46:244-54 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:1385-8 J Med Chem 2005 48:3945-8 2D 3D TSV
Group X secretory phospholipase A2
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 594913/1551.0 - 1200 nM4UY1-TJM Bioorg Med Chem Lett 2014 24:5251-5 2D 3D TSV
Grp78
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5951423/3360.0 - 12000 nM3LDP-3P1 J Med Chem 2011 54:4034-41 2D 3D TSV
heat shock 70kDa protein 8 isoform 1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5961818/31260 - 1000000 nM1HPM-ADP 2QWL-ADP 2QWM-ADP 3C7N-ADP 3HSC-ADP 4H5T-ADP J Med Chem 2010 53:7280-6 PubChem BioAssay aid1193 J Med Chem 2016 59:4625-36 2D 3D TSV
Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5972219/285.80 - 200000 nM4Z1F-H71 J Med Chem 2013 56:6803-18 J Med Chem 2015 58:3922-43 2D 3D TSV
Heat Shock Protein 90 (Hsp90)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 5982119/2419.0 - 100000 nM2IWS-NP4 2IWU-NP5 2IWX-M1S Bioorg Med Chem 2009 17:2225-35 Chem Biol 2006 13:1203-15 2D 3D TSV
Set 5992719/2990.0 - 200000 nM1UYF-PU1 1UYM-PU3 J Med Chem 2015 58:3922-43 J Med Chem 2005 48:2892-905 Bioorg Med Chem Lett 2003 14:325-8 Bioorg Med Chem 2009 17:2225-35 J Med Chem 2006 49:817-28 J Med Chem 2006 49:381-90 2D 3D TSV
Heat shock protein HSP 90-alpha
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 6003123/293.00 - 10000 nM4U93-990 J Med Chem 2014 57:9124-9 US8618290 2D 3D TSV
Set 60116521/3220.0 - 78000 nM2VCJ-2EQ J Med Chem 2012 55:7786-95 US9718793 US10035792 J Med Chem 2017 60:2271-2286 2D 3D TSV
Set 60210218/330.057 - 78000 nM4B7P-9UN 4BQJ-XKL US8993556 J Med Chem 2012 55:7786-95 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:3129-34 US9718793 US10035792 2D 3D TSV
Set 6033622/3517.0 - 10000 nM4LWE-FJ2 4LWH-FJ5 4LWI-FJ6 US9718793 Eur J Med Chem 2014 87:765-81 US10035792 2D 3D TSV
Set 604514/163000 - 1000000 nM3B27-B2T Bioorg Med Chem Lett 2011 21:5778-83 2D 3D TSV
Set 60511621/303.00 - 12000 nM4O04-2Q8 4O05-2Q9 4O07-FGH 4O09-2R6 4O0B-2QA 4XIP-40W 4XIQ-40Y 4XIR-40X Bioorg Med Chem Lett 2011 21:2278-82 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:3627-31 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:4602-7 J Med Chem 2014 57:3382-400 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:1338-42 2D 3D TSV
Set 6063124/331.70 - 300 nM3R4O-FU3 3R4P-FU7 J Med Chem 2011 54:3368-85 J Med Chem 2015 58:5691-8 2D 3D TSV
Set 607719/246.30 - 20000 nM2YI0-YI0 2YI5-YI5 2YI6-6QM 2YI7-BZ8 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:1089-92 2D 3D TSV
Set 608716/2321.0 - 8300 nM3R4N-FU5 J Med Chem 2011 54:3368-85 2D 3D TSV
Set 6091621/290.250 - 120 nM3VHA-VHA 3VHC-VHC 3VHD-VHE Bioorg Med Chem Lett 2012 22:1136-41 2D 3D TSV
Set 610514/1560.0 - 8300 nM3R4M-WOE 2XDX-WOE Chem Biol Drug Des 2007 70:1-12 J Med Chem 2011 54:3368-85 2D 3D TSV
Heat shock protein HSP90
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 61115517/27100 - 500000 nM2FWZ-H71 Bioorg Med Chem 2010 18:5732-7 US10035797 US9630965 J Med Chem 2015 58:3922-43 J Med Chem 2005 48:2892-905 2D 3D TSV
Set 6121620/219.00 - 8700 nM3QDD-94M J Med Chem 2017 60:7569-7578 J Med Chem 2012 55:7786-95 Bioorg Med Chem Lett 2017 27:237-241 2D 3D TSV
Set 61322321/3420.0 - 78000 nM2VCI-2GJ Bioorg Med Chem Lett 2015 25:3129-34 US9718793 US10035792 J Med Chem 2017 60:2271-2286 2D 3D TSV
Heme Oxygenase 1 (HO-1)
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 6146016/2060.0 - 100000 nM2DY5-224 Bioorg Med Chem 2007 15:3225-34 Chem Biol Drug Des 2010 75:68-90 Bioorg Med Chem 2009 17:2461-75 Bioorg Med Chem 2013 21:5145-53 J Med Chem 2006 49:4437-41 Bioorg Med Chem Lett 2005 15:1457-61 2D 3D TSV
Hepatocyte growth factor receptor
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 6153322/290.100 - 2000 nM3I5N-B2D 4DEG-0JJ Bioorg Med Chem Lett 2009 19:6307-12 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:6368-72 US9066954 2D 3D TSV
Set 6163818/343.00 - 780 nM4XMO-46G 4XYF-44X 5EYC-5SZ 5EYD-5T1 J Med Chem 2015 58:2417-30 J Med Chem 2016 59:2328-42 2D 3D TSV
Set 6171324/329.80 - 5300 nM4R1V-3E8 Bioorg Med Chem Lett 2015 25:1597-602 Eur J Med Chem 2015 95:302-12 US9403799 2D 3D TSV
Set 61816527/410.210 - 20000 nM3U6H-03X 3U6I-044 ACS Med Chem Lett 2014 5:298-303 Bioorg Med Chem Lett 2016 26:1794-8 J Med Chem 2016 59:3593-608 Eur J Med Chem 2014 83:581-93 Bioorg Med Chem 2014 22:6438-52 Bioorg Chem 2017 72:116-122 J Med Chem 2012 55:1858-67 Eur J Med Chem 2014 80:254-66 Eur J Med Chem 2016 120:37-50 US8975282 US9133162 J Med Chem 2012 55:1868-97 Eur J Med Chem 2011 46:3675-80 Eur J Med Chem 2016 119:96-108 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:2745-9 US9745283 Bioorg Med Chem 2014 22:3642-53 Eur J Med Chem 2013 64:62-73 2D 3D TSV
Set 6194329/423.80 - 10000 nM4MXC-DWF ACS Med Chem Lett 2014 5:673-8 Bioorg Med Chem 2017 25:3195-3205 2D 3D TSV
Set 6201921/28170 - 60000 nM3F66-IHX Bioorg Med Chem Lett 2008 19:397-400 Eur J Med Chem 2011 46:3675-80 2D 3D TSV
Set 6212521/320.720 - 10000 nM4GG5-0J3 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:6368-72 J Med Chem 2011 54:2127-42 Eur J Med Chem 2011 46:3675-80 2D 3D TSV
Set 622818/2420.0 - 310 nM2WD1-ZZY Bioorg Med Chem Lett 2009 19:2780-4 Eur J Med Chem 2011 46:3675-80 2D 3D TSV
Set 6231525/322.00 - 110 nM4DEI-0JL Bioorg Med Chem Lett 2012 22:4089-93 2D 3D TSV
Set 6243023/3430.0 - 10000 nM4KNB-1RU Bioorg Med Chem Lett 2013 23:4381-7 2D 3D TSV
Hexokinase type IV
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 6256524/306.20 - 16000 nM3A0I-AJI US9527838 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:2718-21 Bioorg Med Chem Lett 2017 27:2063-2068 2D 3D TSV
Set 6264516/2367.1 - 30000 nM1V4S-MRK 3FR0-AJB 3GOI-LOI Bioorg Med Chem 2009 17:3800-9 Bioorg Med Chem 2009 17:7301-12 ACS Med Chem Lett 2013 4:580-4 Bioorg Med Chem 2009 17:2733-43 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:3247-52 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:2718-21 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:1357-60 2D 3D TSV
Set 6272620/27200 - 50000 nM4RCH-3LZ J Med Chem 2014 57:8180-6 2D 3D TSV
Set 6282919/2670.0 - 27000 nM4DCH-4DC J Med Chem 2008 51:4340-5 ACS Med Chem Lett 2013 4:580-4 Bioorg Med Chem 2010 18:3875-84 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:3247-52 Eur J Med Chem 2014 76:182-92 2D 3D TSV
Set 6292322/2979.0 - 100000 nM4ISE-1FW 4ISF-1FX Bioorg Med Chem Lett 2013 23:2166-71 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:3247-52 2D 3D TSV
Set 6301323/2763.0 - 100000 nM4ISG-1FY Bioorg Med Chem Lett 2013 23:2166-71 2D 3D TSV
Set 6311820/2177.0 - 12000 nM4MLE-VO1 4MLH-VO2 J Med Chem 2013 56:7669-78 2D 3D TSV
Histone acetyltransferase PCAF
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 6321140/48300 - 200000 nM1CM0-COA 4NSQ-COA Bioorg Med Chem 2009 17:1381-6 J Med Chem 2016 59:1249-70 Bioorg Med Chem Lett 2013 24:113-6 2D 3D TSV
Histone deacetylase 2
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 6336716/244.90 - 200000 nM4LY1-20Y J Med Chem 2007 50:5543-6 Bioorg Med Chem Lett 2009 19:2053-8 US9790180 J Biol Chem 2013 288:26926-43 ACS Chem Biol 2016 11:363-74 Bioorg Med Chem Lett 2010 20:3142-5 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:5025-30 US9145412 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:973-8 Eur J Med Chem 2010 45:2095-116 US9040727 Bioorg Med Chem Lett 2012 22:1926-30 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:726-31 Bioorg Med Chem Lett 2008 18:6104-9 2D 3D TSV
Histone deacetylase 4
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 6342919/2820.0 - 1800 nM4CBT-9F4 ACS Med Chem Lett 2016 7:34-9 US9765054 2D 3D TSV
Histone deacetylase 7
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 6353213/18210 - 1000000 nM3C0Z-SHH Bioorg Med Chem Lett 2003 13:4321-6 Bioorg Med Chem Lett 2003 14:449-53 J Med Chem 2011 54:2165-82 US9265734 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:3313-7 2D 3D TSV
Histone deacetylase 8
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 6365213/19190 - 1000000 nM1T69-SHH J Med Chem 2014 57:8358-77 Bioorg Med Chem Lett 2003 13:4321-6 Bioorg Med Chem Lett 2003 14:449-53 J Med Chem 2011 54:2165-82 J Med Chem 2015 58:4812-21 US9265734 J Med Chem 2008 51:1505-29 Bioorg Med Chem Lett 2004 14:3313-7 Bioorg Med Chem Lett 2011 21:5854-8 ACS Med Chem Lett 2017 8:281-286 2D 3D TSV
Histone-arginine methyltransferase CARM1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 637922/313000 - 100000 nM2Y1X-SAH 3B3F-SAH J Med Chem 2015 58:1596-629 J Med Chem 2012 55:8066-74 Eur J Med Chem 2012 56:179-194 2D 3D TSV
Histone-lysine N-methyltransferase EHMT1
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 638722/301500 - 510000 nM3FPD-SAH 3HNA-SAH 3MO0-SAH 3MO2-SAH 3MO5-SAH 2IGQ-SAH 2RFI-SAH 3SW9-SFG 3SWC-SAH Bioorg Med Chem Lett 2015 25:1532-7 ACS Med Chem Lett 2014 5:293-7 2D 3D TSV
Set 639722/3515.0 - 100000 nM3FPD-Q4A 3MO5-E72 J Med Chem 2014 57:6822-33 J Med Chem 2010 53:5844-57 J Med Chem 2011 54:6139-50 Eur J Med Chem 2012 56:179-194 2D 3D TSV
Histone-lysine N-methyltransferase EZH2
Compoundsmin/max MCSSAffinity (nM)Structures (PDB ids)Data Source(Articles)SDfile
Set 6402021/30270 - 120000 nM5HYN-SAH Bioorg Med Chem Lett 2015 25:1532-7 US9175331 US8895245 US9333217 2D 3D TSV
Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-79 specific
Compoundsmin/ma